PEAX: Interactive Visual Pattern Search in Sequential Data Using Unsupervised Deep Representation Le
论文传送门 视频 代码 作者 哈佛大学工程与应用科学学院 Fritz Lekschas Daniel Haehn (马萨诸塞大学) Hanspeter Pfister 诺华生物医学研究所 Brant Peterson Eric Ma 哈佛大学医学院 Nils Gehlenborg 摘要 我们介绍了PEAX,一种基于特征的新颖技术,用于在序列数据(例如时间序列或映射到基因组序列的数据)中进行交互式视觉模式搜索。由于存在很大的搜索空间,模式的视觉复杂性以及用户对相似性的感知,因此以视觉方式通过相似性搜索模式通常具有挑战性。例如,在基因组学中,研究人员试图将多元顺序数据中的模式与细胞或病原体过程联系起来,但是由于缺乏真实数据和高方差,因此自动模式检测不可靠。我们已经开发了卷积自动编码器,用于顺序数据中区域的无监督表示学习,与现有的相似性度量相比,它可以捕获复杂模式的更多视觉细节。利用这种学习到的表示作为顺序数据的特征,我们随附的可视化查询系统可以对模式搜索进行交互式反馈驱动的调整,以适应用户的感知相似性。PEAX使用主动学习采样策略,收集用户生成的二类相关性反馈。该反馈用于训练二分类的模型,以最终找到表现出类似于搜索目标的模式的其他区域。我们通过基因组学案例研究来证明PEAX的功能,并与八位领域专家一起进行用户研究报告,以评估PEAX的可用性和实用性。此外