公众号那个留言想看基因组选择视频的人,注意了,视频来了!
1. 我和bilibili的故事
刚来到公司,领导告诉我,哔哩哔哩是个好东西,抱着试试看的态度,我打开了界面,什么?二次元,漫画我只看过进击的巨人好不好,这种style完全不是我的菜。
不安利哔哩哔哩的领导不是好的数据分析师,有一天,我对领导讲,腾讯课堂有很多生信的视频,很好啊!领导看了我一眼,说哔哩哔哩上面很多啊,还有人直播写代码呢。然后直播也不是我的菜。
后来,我注册了一个账号,但是他们的平台,要答题才能成为会员,它们的题目太多了,最重要的是,我不会这些题目!!!
再后来,我领导拿起我的手机,让我下去玩滑板,领导把题目给我做好了,于是我就成了哔哩哔哩的会员。。。
写这么多,是因为拍领导马屁一定要拍到正地方,有一句话讲:如果你想表扬别人,一定要从细节着手。因此我写了上面的话,用来描述我拍马屁的套路。
2. 我在bilibili上干了什么?
我上传了一些视频,这些视频我认为是很不错的,但是国内看不了,是我从YouTube下载的,关于全基因组选择,关于多年多点育种值和遗传力计算,关于全基因组关联分析,关于农业试验设计,关于农业数据分析等等。具体如下:
2.1 全基因组选择
这里面有两个视频,英文的,有PPT,回头我会将数据和代码上传到公众号上。英文讲的也很清楚,可以练练听力,很不错喔。
2.2 全基因组选择
这里有TASSEL的使用方法,QTL定位,表型数据遗传力计算等等。
2.3 根据多年多点数据使用R语言计算遗传力和育种值
这个视频,影响力太大了,目前很多人做多年多点的数据时,都要参考他的R代码,原始的数据和代码我后期会上传到公众号上。视频分为三节,讲的非常详细。
2.4 混合线性模型介绍
这里面包括15个视频,讲解混合线性模型,必须要看有没有。
2.5 植物育种与田间试验设计
你想知道alpha-lattice怎么设计,数据如何分析?
你想了解增广试验设计的分析方法?
里面都包含,应有尽有,无所不有。
3. 自我吹捧
可以这样讲,我已经将网络上,关于混合线性模型,关于基因组选择,关于田间试验设计,关于育种值,遗传力,BLUP之计算的视频都汇总在我的哔哩哔哩上面了。
如果你觉得不错,不要吝惜发朋友圈和点好看,毕竟我的公众号是我的QQ空间,你们的一举一动都在老大哥的视线之下。。。
4. 地址在哪里?
1, 关注我的公众号
2,点击原文阅读即可链接到我的哔哩哔哩上,里面有列表介绍。
我正在考虑是否有必要将相关内容,录成中文视频,然后放在哔哩哔哩上,问题来了:成为网红的风口是否已经到来(严肃脸)?
生物统计:
主要包括试验设计,生物统计中的数据分析,育种中的数据分析,相关的文献解读。
2,P-rep designs 文献解析及实现方法
3,RCBD和alpha-lattice试验效率比较
4,如何对增广试验数据进行分析
8,农业统计分析系列2-试验设计
12, 不同试验设计遗传力的计算方法
13, 农业大数据时代的几个案例
14, 农业试验中如何分析单因素方差分析
16, 文献阅读:林木中遗传参数评估
数量遗传:
主要是动物数量遗传,动物育种中应用比较广泛,无论是基于系谱的动物模型,近交系数,亲缘关系系数,配合力,育种值,还是单性状模型,重复力模型,多性状模型等相关知识。
18, 文献阅读: ABLUP-GBLUP-SSGBLUP模拟数据比较
19, 文献阅读:林木中遗传参数评估
20, 遗传变异系数怎么计算
21, 测定日模型及随机模型介绍
编程语言:
包括Python,R语言,Julia,Perl语言,Linux的Shell语言,主要是我平时学习时的一些笔记和总结。
15, snakemake 学习笔记1
16, snakemake 学习笔记2
18, WOX 糙快猛的实现方法
20, 几种加快R语言运算的方法
21, 如何批量安装R语言包
基因组选择:
育种数据分析中,表型选择,方差分析,混合线性模型的BLUP育种值是学科的枝干,MAS,GWAS是花苞, GS则是盛开的花朵,其依赖于常规的数量遗传理论,但青出于蓝而胜于蓝,具有光明的前景,由于GS的应用,分子育种的落地又大大提前了一步。现在GS在动物育种中,特别是牛,猪,鸡,羊中正在大规模落地,以后再玉米,水稻,小麦,大豆的应用也将落地。冬天来了,春天还会远么?这个章节有文献解析,SNP数据清洗,G矩阵及H矩阵构建,模拟数据,软件使用,理论介绍等等。
1,QMSim 基因组数据模拟软件-介绍
2,关于SNP在染色体上的分布图怎么做
14, 基因组选择和SNP分析在ASREML-SA中的实现方法
15, 基因组选择分析软件调研
放飞自我系列:
所谓放飞自我, 就是放飞自我系列.
22, 上士闻道
24, 我年薪百万的故事
25, 从读书到别人思想的跑马场
26, 反对996为什么是一场闹剧
本文分享自微信公众号 - 育种数据分析之放飞自我(R-breeding)。
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