R语言可视化学习笔记之添加p-value和显著性标记
R语言可视化学习笔记之添加p-value和显著性标记 http://www.jianshu.com/p/b7274afff14f?from=timeline 上篇文章中提了一下如何通过ggpubr包为 ggplot 图添加 p-value 以及显著性标记,本文将详细介绍。利用数据集ToothGrowth进行演示 #先加载包 library(ggpubr) #加载数据集ToothGrowth data("ToothGrowth") head(ToothGrowth) ## len supp dose ## 1 4.2 VC 0.5 ## 2 11.5 VC 0.5 ## 3 7.3 VC 0.5 ## 4 5.8 VC 0.5 ## 5 6.4 VC 0.5 ## 6 10.0 VC 0.5 比较方法 R中常用的比较方法主要有下面几种: 方法 R函数 描述 T-test t.test() 比较两组(参数) Wilcoxon test wilcox.test() 比较两组(非参数) ANOVA aov()或anova() 比较多组(参数) Kruskal-Wallis kruskal.test() 比较多组(非参数) 各种比较方法后续有时间一一讲解。 添加 p-value 主要利用ggpubr包中的两个函数: compare_means() :可以进行一组或多组间的比较 stat