一、天气最高温度预测任务
实验数据以及源代码 https://github.com/wyn-365/temp-predict.git
1.1 任务
我们要完成三项任务:
使用随机森林算法完成基本建模任务
基本任务需要我们处理数据,观察特征,完成建模并进行可视化展示分析
观察数据量与特征个数对结果影响
在保证算法一致的前提下,加大数据个数,观察结果变换。重新考虑特征工程,引入新特征后观察结果走势。
对随机森林算法进行调参,找到最合适的参数
掌握机器学习中两种经典调参方法,对当前模型进行调节
# 数据读取
import pandas as pd
features = pd.read_csv('data/temps.csv')
features.head(5)
数据表中
year,moth,day,week分别表示的具体的时间
temp_2:前天的最高温度值
temp_1:昨天的最高温度值
average:在历史中,每年这一天的平均最高温度值
actual:这就是我们的标签值了,当天的真实最高温度
friend:这一列可能是凑热闹的,你的朋友猜测的可能值,咱们不管它就好了
1.2 数据大小
print('The shape of our features is:', features.shape)
# 统计指标
features.describe()
# 对于时间数据,我们也可以进行一些转换,目的就是有些工具包在绘图或者计算的过程中,需要标准的时间格式:
# 处理时间数据
import datetime
# 分别得到年,月,日
years = features['year']
months = features['month']
days = features['day']
# datetime格式
dates = [str(int(year)) + '-' + str(int(month)) + '-' + str(int(day)) for year, month, day in zip(years, months, days)]
dates = [datetime.datetime.strptime(date, '%Y-%m-%d') for date in dates]
dates[:5]
结果显示:The shape of our features is: (348, 9),表示我们的数据一共有348条记录,每个样本有9个特征。如果你想观察一下各个指标的统计特性,还可以用.describe()来直接展示一下:
1.3 数据展示
# 准备画图
import matplotlib.pyplot as plt
%matplotlib inline
# 指定默认风格
plt.style.use('fivethirtyeight')
# 接着我们设计画图的布局,这里我们需要展示4项指标,分别为最高气温的标签值,前天,昨天,朋友预测的气温最高值。既然是4个图,那不妨就2*2的规模来画吧,这样会更清晰一点,对每个图再指定好其名字和坐标轴含义就可以了:
# 设置布局
fig, ((ax1, ax2), (ax3, ax4)) = plt.subplots(nrows=2, ncols=2, figsize = (10,10))
fig.autofmt_xdate(rotation = 45)
# 标签值
ax1.plot(dates, features['actual'])
ax1.set_xlabel(''); ax1.set_ylabel('Temperature'); ax1.set_title('Max Temp')
# 昨天
ax2.plot(dates, features['temp_1'])
ax2.set_xlabel(''); ax2.set_ylabel('Temperature'); ax2.set_title('Previous Max Temp')
# 前天
ax3.plot(dates, features['temp_2'])
ax3.set_xlabel('Date'); ax3.set_ylabel('Temperature'); ax3.set_title('Two Days Prior Max Temp')
# 我的逗逼朋友
ax4.plot(dates, features['friend'])
ax4.set_xlabel('Date'); ax4.set_ylabel('Temperature'); ax4.set_title('Friend Estimate')
plt.tight_layout(pad=2)
# 各项指标看起来都还算正常,由于是国外的天气数据所以跟咱们的统计标准有些区别。接下来就要考虑数据预处理问题了,原始数据中在week列中并不是一些数值特征,而是表示周几的字符串,这些计算机可不认识,需要我们来转换一下:
1.5 数据预处理
# 独热编码
features = pd.get_dummies(features)
features.head(5)
# 这样就完成了数据集中属性值的预处理工作,默认会把所有属性值都转换成独热编码的格式,并且还帮我们自动添加了后缀看起来更清晰了,这里我们其实也可以按照自己的方式来设置编码特征的名字的,如果大家遇到了一个不太熟悉的函数,想看一下其中的细节,有一个更直接的方法就是在notebook当中直接调help工具来看一下它的API文档,下面返回的就是其细节介绍,不光有各个参数说明,还有一些小例子,建议大家在使用的过程中一定要养成多练多查的习惯,查找解决问题的方法也是一个很重要的技能:
print (help(pd.get_dummies))
print('Shape of features after one-hot encoding:', features.shape)
# 数据与标签
import numpy as np
# 标签
labels = np.array(features['actual'])
# 在特征中去掉标签
features= features.drop('actual', axis = 1)
# 名字单独保存一下,以备后患
feature_list = list(features.columns)
# 转换成合适的格式
features = np.array(features)
1.6 训练集与测试集
# 数据集切分
from sklearn.model_selection import train_test_split
train_features, test_features, train_labels, test_labels = train_test_split(features, labels, test_size = 0.25,
random_state = 42)
print('训练集特征:', train_features.shape)
print('训练集标签:', train_labels.shape)
print('测试集特征:', test_features.shape)
print('测试集标签:', test_labels.shape)
1.7 建立一个基础的随机森林模型
万事俱备,我们可以来建立随机森林模型啦,首先导入工具包,先建立1000个树试试吧,其他参数先用默认值,之后我们会再深入到调参任务中
# 导入算法
from sklearn.ensemble import RandomForestRegressor
# 建模
rf = RandomForestRegressor(n_estimators= 1000, random_state=42)
# 训练
rf.fit(train_features, train_labels)
# 由于数据样本量还是非常小的,所以很快就可以得到结果了,这里我们先用MAPE指标来进行评估,也就是平均绝对百分误差,其实对于回归任务,评估方法还是比较多,给大家列出来几种,很简单就可以实现出来,也可以选择其他指标来进行评估:
1.8 测试
# 预测结果
predictions = rf.predict(test_features)
# 计算误差
errors = abs(predictions - test_labels)
# mean absolute percentage error (MAPE)
mape = 100 * (errors / test_labels)
print ('MAPE:',np.mean(mape))
1.9 特征重要性
# 得到特征重要性
importances = list(rf.feature_importances_)
# 转换格式
feature_importances = [(feature, round(importance, 2)) for feature, importance in zip(feature_list, importances)]
# 排序
feature_importances = sorted(feature_importances, key = lambda x: x[1], reverse = True)
# 对应进行打印
[print('Variable: {:20} Importance: {}'.format(*pair)) for pair in feature_importances]
1.10 用最重要的特征再来试试
# 选择最重要的那两个特征来试一试
rf_most_important = RandomForestRegressor(n_estimators= 1000, random_state=42)
# 拿到这俩特征
important_indices = [feature_list.index('temp_1'), feature_list.index('average')]
train_important = train_features[:, important_indices]
test_important = test_features[:, important_indices]
# 重新训练模型
rf_most_important.fit(train_important, train_labels)
# 预测结果
predictions = rf_most_important.predict(test_important)
errors = abs(predictions - test_labels)
# 评估结果
mape = np.mean(100 * (errors / test_labels))
print('mape:', mape)
# 转换成list格式
x_values = list(range(len(importances)))
# 绘图
plt.bar(x_values, importances, orientation = 'vertical')
# x轴名字
plt.xticks(x_values, feature_list, rotation='vertical')
# 图名
plt.ylabel('Importance'); plt.xlabel('Variable'); plt.title('Variable Importances');
1.11 预测值与真实值之间的差异
# 日期数据
months = features[:, feature_list.index('month')]
days = features[:, feature_list.index('day')]
years = features[:, feature_list.index('year')]
# 转换日期格式
dates = [str(int(year)) + '-' + str(int(month)) + '-' + str(int(day)) for year, month, day in zip(years, months, days)]
dates = [datetime.datetime.strptime(date, '%Y-%m-%d') for date in dates]
# 创建一个表格来存日期和其对应的标签数值
true_data = pd.DataFrame(data = {'date': dates, 'actual': labels})
# 同理,再创建一个来存日期和其对应的模型预测值
months = test_features[:, feature_list.index('month')]
days = test_features[:, feature_list.index('day')]
years = test_features[:, feature_list.index('year')]
test_dates = [str(int(year)) + '-' + str(int(month)) + '-' + str(int(day)) for year, month, day in zip(years, months, days)]
test_dates = [datetime.datetime.strptime(date, '%Y-%m-%d') for date in test_dates]
predictions_data = pd.DataFrame(data = {'date': test_dates, 'prediction': predictions})
# 真实值
plt.plot(true_data['date'], true_data['actual'], 'b-', label = 'actual')
# 预测值
plt.plot(predictions_data['date'], predictions_data['prediction'], 'ro', label = 'prediction')
plt.xticks(rotation = '60');
plt.legend()
# 图名
plt.xlabel('Date'); plt.ylabel('Maximum Temperature (F)'); plt.title('Actual and Predicted Values');
plt.show()
看起来还可以,这个走势我们的模型已经基本能够掌握了,接下来我们要再深入到数据中了,考虑几个问题: 1.如果可以利用的数据量增大,会对结果产生什么影响呢? 2.加入新的特征会改进模型效果吗?此时的时间效率又会怎样?
二、更多的数据效果会不会更好呢?
2.1 数据导入
# 导入工具包
import pandas as pd
# 读取数据
features = pd.read_csv('data/temps_extended.csv')
features.head(5)
print('数据规模',features.shape)
# 统计指标
round(features.describe(), 2)
数据规模 (2191, 12)
新的数据中,数据规模发生了变化,数据量扩充到了2191条并且加入了新的天气指标:
ws_1:前一天的风速
prcp_1: 前一天的降水
snwd_1:前一天的积雪深度
既然有了新的特征,先来看看他们长什么样吧,同样的方式绘制就可以了:
2.2 数据时间处理
# 转换成标准格式
import datetime
# 得到各种日期数据
years = features['year']
months = features['month']
days = features['day']
# 格式转换
dates = [str(int(year)) + '-' + str(int(month)) + '-' + str(int(day)) for year, month, day in zip(years, months, days)]
dates = [datetime.datetime.strptime(date, '%Y-%m-%d') for date in dates]
# 绘图
import matplotlib.pyplot as plt
%matplotlib inline
# 风格设置
plt.style.use('fivethirtyeight')
# Set up the plotting layout
fig, ((ax1, ax2), (ax3, ax4)) = plt.subplots(nrows=2, ncols=2, figsize = (15,10))
fig.autofmt_xdate(rotation = 45)
# Actual max temperature measurement
ax1.plot(dates, features['actual'])
ax1.set_xlabel(''); ax1.set_ylabel('Temperature (F)'); ax1.set_title('Max Temp')
# Temperature from 1 day ago
ax2.plot(dates, features['temp_1'])
ax2.set_xlabel(''); ax2.set_ylabel('Temperature (F)'); ax2.set_title('Prior Max Temp')
# Temperature from 2 days ago
ax3.plot(dates, features['temp_2'])
ax3.set_xlabel('Date'); ax3.set_ylabel('Temperature (F)'); ax3.set_title('Two Days Prior Max Temp')
# Friend Estimate
ax4.plot(dates, features['friend'])
ax4.set_xlabel('Date'); ax4.set_ylabel('Temperature (F)'); ax4.set_title('Friend Estimate')
plt.tight_layout(pad=2)
# 设置整体布局
fig, ((ax1, ax2), (ax3, ax4)) = plt.subplots(nrows=2, ncols=2, figsize = (15,10))
fig.autofmt_xdate(rotation = 45)
# 平均最高气温
ax1.plot(dates, features['average'])
ax1.set_xlabel(''); ax1.set_ylabel('Temperature (F)'); ax1.set_title('Historical Avg Max Temp')
# 风速
ax2.plot(dates, features['ws_1'], 'r-')
ax2.set_xlabel(''); ax2.set_ylabel('Wind Speed (mph)'); ax2.set_title('Prior Wind Speed')
# 降水
ax3.plot(dates, features['prcp_1'], 'r-')
ax3.set_xlabel('Date'); ax3.set_ylabel('Precipitation (in)'); ax3.set_title('Prior Precipitation')
# 积雪
ax4.plot(dates, features['snwd_1'], 'ro')
ax4.set_xlabel('Date'); ax4.set_ylabel('Snow Depth (in)'); ax4.set_title('Prior Snow Depth')
plt.tight_layout(pad=2)
在数据分析和特征提取的过程中,我们的出发点都是尽可能多的选择有价值的特征,因为其实阶段我们能得到的信息越多,之后建模可以利用的信息也是越多的,比如在这份数据中,我们有完整日期数据,但是显示天气的变换肯定是跟季节因素有关的,但是在原始数据集中并没有体现出季节的指标,我们可以自己创建一个季节变量当做新的特征,无论是对之后建模还是分析都会起到帮助的: 有了季节特征之后,假如我想观察一下不同季节的时候上述各项指标的变换情况该怎么做呢?这里给大家推荐一个非常实用的绘图函数pairplot,需要我们先安装seaborn这个工具包,它相当于是在Matplotlib的基础上进行封装,说白了就是用起来更简单规范了:
2.3 画图
# 创建一个季节变量
seasons = []
for month in features['month']:
if month in [1, 2, 12]:
seasons.append('winter')
elif month in [3, 4, 5]:
seasons.append('spring')
elif month in [6, 7, 8]:
seasons.append('summer')
elif month in [9, 10, 11]:
seasons.append('fall')
# 有了季节我们就可以分析更多东西了
reduced_features = features[['temp_1', 'prcp_1', 'average', 'actual']]
reduced_features['season'] = seasons
# 导入seaborn工具包
import seaborn as sns
sns.set(style="ticks", color_codes=True);
# 选择你喜欢的颜色模板
palette = sns.xkcd_palette(['dark blue', 'dark green', 'gold', 'orange'])
# 绘制pairplot
sns.pairplot(reduced_features, hue = 'season', diag_kind = 'kde', palette= palette, plot_kws=dict(alpha = 0.7),
diag_kws=dict(shade=True));
可以看到,x轴和y轴都是我们这4项指标,不同颜色的点表示不同的季节,在主对角线上x轴和y轴都是相同特征表示其在不同季节时的数值分布情况,其他位置用散点图来表示两个特征之间的关系,例如在左下角temp_1和actual就呈现出了很强的相关性。
2.4 数据预处理
# 独热编码
features = pd.get_dummies(features)
# 提取特征和标签
labels = features['actual']
features = features.drop('actual', axis = 1)
# 特征名字留着备用
feature_list = list(features.columns)
# 转换成所需格式
import numpy as np
features = np.array(features)
labels = np.array(labels)
# 数据集切分
from sklearn.model_selection import train_test_split
train_features, test_features, train_labels, test_labels = train_test_split(features, labels,
test_size = 0.25, random_state = 0)
print('Training Features Shape:', train_features.shape)
print('Training Labels Shape:', train_labels.shape)
print('Testing Features Shape:', test_features.shape)
print('Testing Labels Shape:', test_labels.shape)
# 新的训练集由1643个样本组成,测试集有548个样本。先来看看老数据集的情况,这里由于我们重新打开了一个新的notebook,所有代码中重新读取了老温度数据集,并进行了相同的预处理操作:
2.5 先看看老数据的结果
# 工具包导入
import pandas as pd
# 为了剔除特征个数对结果的影响,这里特征统一只有老数据集中特征
original_feature_indices = [feature_list.index(feature) for feature in
feature_list if feature not in
['ws_1', 'prcp_1', 'snwd_1']]
# 读取老数据集
original_features = pd.read_csv('data/temps.csv')
original_features = pd.get_dummies(original_features)
import numpy as np
# 数据和标签转换
original_labels = np.array(original_features['actual'])
original_features= original_features.drop('actual', axis = 1)
original_feature_list = list(original_features.columns)
original_features = np.array(original_features)
# 数据集切分
from sklearn.model_selection import train_test_split
original_train_features, original_test_features, original_train_labels, original_test_labels = train_test_split(original_features, original_labels, test_size = 0.25, random_state = 42)
# 同样的树模型进行建模
from sklearn.ensemble import RandomForestRegressor
# 同样的参数与随机种子
rf = RandomForestRegressor(n_estimators= 100, random_state=0)
# 这里的训练集使用的是老数据集的
rf.fit(original_train_features, original_train_labels);
# 为了测试效果能够公平,统一使用一致的测试集,这里选择了刚刚我切分过的新数据集的测试集
predictions = rf.predict(test_features[:,original_feature_indices])
# 先计算温度平均误差
errors = abs(predictions - test_labels)
print('平均温度误差:', round(np.mean(errors), 2), 'degrees.')
# MAPE
mape = 100 * (errors / test_labels)
# 这里的Accuracy为了方便观察,我们就用100减去误差了,希望这个值能够越大越好
accuracy = 100 - np.mean(mape)
print('Accuracy:', round(accuracy, 2), '%.')
可以看到,当我们把数据量增大之后,效果发生了一些提升,这也符合实际情况,在机器学习任务中,我们都是希望数据量能够越大越好,这样可利用的信息就更多了。 下面我们要再对比一下特征数量对结果的影响,之前这两次比较还没有加入新的特征,这回我们把降水,风速,积雪3特征加入训练集中,看看效果又会怎样:
2.6 新数据来了,只增大数据量的话,结果会提升吗
from sklearn.ensemble import RandomForestRegressor
# 剔除掉新的特征,保证数据特征是一致的
original_train_features = train_features[:,original_feature_indices]
original_test_features = test_features[:, original_feature_indices]
rf = RandomForestRegressor(n_estimators= 100 ,random_state=0)
rf.fit(original_train_features, train_labels);
# 预测
baseline_predictions = rf.predict(original_test_features)
# 结果
baseline_errors = abs(baseline_predictions - test_labels)
print('平均温度误差:', round(np.mean(baseline_errors), 2), 'degrees.')
# (MAPE)
baseline_mape = 100 * np.mean((baseline_errors / test_labels))
# accuracy
baseline_accuracy = 100 - baseline_mape
print('Accuracy:', round(baseline_accuracy, 2), '%.')
2.7 加入新特征再来看一看
# 准备加入新的特征
from sklearn.ensemble import RandomForestRegressor
rf_exp = RandomForestRegressor(n_estimators= 100, random_state=0)
rf_exp.fit(train_features, train_labels)
# 同样的测试集
predictions = rf_exp.predict(test_features)
# 评估
errors = abs(predictions - test_labels)
print('平均温度误差:', round(np.mean(errors), 2), 'degrees.')
# (MAPE)
mape = np.mean(100 * (errors / test_labels))
# 看一下提升了多少
improvement_baseline = 100 * abs(mape - baseline_mape) / baseline_mape
print('特征增多后模型效果提升:', round(improvement_baseline, 2), '%.')
# accuracy
accuracy = 100 - mape
print('Accuracy:', round(accuracy, 2), '%.')
模型整体效果有了略微提升,这里我们还加入一项额外的评估就是模型跟基础模型相比提升的大小,方便来进行对比观察。这回特征也多了,我们可以好好研究下特征重要性这个指标了,虽说其只供参考,但是业界也有一些不成文的行规我们来看一下:
2.8 特征重要性
# 特征名字
importances = list(rf_exp.feature_importances_)
# 名字,数值组合在一起
feature_importances = [(feature, round(importance, 2)) for feature, importance in zip(feature_list, importances)]
# 排序
feature_importances = sorted(feature_importances, key = lambda x: x[1], reverse = True)
# 打印出来
[print('Variable: {:20} Importance: {}'.format(*pair)) for pair in feature_importances];
# 指定风格
plt.style.use('fivethirtyeight')
# 指定位置
x_values = list(range(len(importances)))
# 绘图
plt.bar(x_values, importances, orientation = 'vertical', color = 'r', edgecolor = 'k', linewidth = 1.2)
# x轴名字得竖着写
plt.xticks(x_values, feature_list, rotation='vertical')
# 图名
plt.ylabel('Importance'); plt.xlabel('Variable'); plt.title('Variable Importances');
之前我们只是简单看了下载特征中哪些更重要,这回我们需要考虑的是特征的累加重要性,先把特征按照其重要性进行排序,再算起累计值,这里用到了cumsum()函数,比如cusm([1,2,3,4])得到的结果就是其累加值(1,3,6,10),通常我们都以95%为阈值,看看有多少个特征累加在一起之后,其特征重要性的累加值超过该阈值,就取它们当做筛选后的特征:
2.9 特征重要性累加,看看95%之前有多少个
# 对特征进行排序
sorted_importances = [importance[1] for importance in feature_importances]
sorted_features = [importance[0] for importance in feature_importances]
# 累计重要性
cumulative_importances = np.cumsum(sorted_importances)
# 绘制折线图
plt.plot(x_values, cumulative_importances, 'g-')
# 画一条红色虚线,0.95那
plt.hlines(y = 0.95, xmin=0, xmax=len(sorted_importances), color = 'r', linestyles = 'dashed')
# X轴
plt.xticks(x_values, sorted_features, rotation = 'vertical')
# Y轴和名字
plt.xlabel('Variable'); plt.ylabel('Cumulative Importance'); plt.title('Cumulative Importances');
#### 这里当第5个特征出现的时候,其总体的累加值超过了95%,那么接下来我们的对比实验又来了,如果只用这5个特征效果会怎么样呢?时间效率又会怎样呢?
# 看看有几个特征
print('Number of features for 95% importance:', np.where(cumulative_importances > 0.95)[0][0] + 1)
# 选择这些特征
important_feature_names = [feature[0] for feature in feature_importances[0:5]]
# 找到它们的名字
important_indices = [feature_list.index(feature) for feature in important_feature_names]
# 重新创建训练集
important_train_features = train_features[:, important_indices]
important_test_features = test_features[:, important_indices]
# 数据维度
print('Important train features shape:', important_train_features.shape)
print('Important test features shape:', important_test_features.shape)
# 再训练模型
rf_exp.fit(important_train_features, train_labels);
# 同样的测试集
predictions = rf_exp.predict(important_test_features)
# 评估结果
errors = abs(predictions - test_labels)
print('平均温度误差:', round(np.mean(errors), 2), 'degrees.')
mape = 100 * (errors / test_labels)
# accuracy
accuracy = 100 - np.mean(mape)
print('Accuracy:', round(accuracy, 2), '%.')
效果反而下降了,其实随机森林的算法本身就会考虑特征的问题,会优先选择有价值的,我们认为的去掉一些,相当于可供候选的就少了,出现这样的现象在随机森林中并不奇怪!
2.10 计算下时间效率
# 要计算时间了
import time
# 这次是用所有特征
all_features_time = []
# 算一次可能不太准,来10次取个平均
for _ in range(10):
start_time = time.time()
rf_exp.fit(train_features, train_labels)
all_features_predictions = rf_exp.predict(test_features)
end_time = time.time()
all_features_time.append(end_time - start_time)
all_features_time = np.mean(all_features_time)
print('使用所有特征时建模与测试的平均时间消耗:', round(all_features_time, 2), '秒.')
当我们使用全部特征的时候,建模与测试用的总时间为0.5秒,这里会由于机器性能导致咱们的速度不一样,大家在笔记本中估计运行时间要比我的稍长一点。再来看看只选择高重要性特征的时间结果:
# 这次是用部分重要的特征
reduced_features_time = []
# 算一次可能不太准,来10次取个平均
for _ in range(10):
start_time = time.time()
rf_exp.fit(important_train_features, train_labels)
reduced_features_predictions = rf_exp.predict(important_test_features)
end_time = time.time()
reduced_features_time.append(end_time - start_time)
reduced_features_time = np.mean(reduced_features_time)
print('使用所有特征时建模与测试的平均时间消耗:', round(reduced_features_time, 2), '秒.')
# Accuracy vs Run-Time用分别的预测值来计算评估结果
all_accuracy = 100 * (1- np.mean(abs(all_features_predictions - test_labels) / test_labels))
reduced_accuracy = 100 * (1- np.mean(abs(reduced_features_predictions - test_labels) / test_labels))
#创建一个df来保存结果
comparison = pd.DataFrame({'features': ['all (17)', 'reduced (5)'],
'run_time': [round(all_features_time, 2), round(reduced_features_time, 2)],
'accuracy': [round(all_accuracy, 2), round(reduced_accuracy, 2)]})
comparison[['features', 'accuracy', 'run_time']]
relative_accuracy_decrease = 100 * (all_accuracy - reduced_accuracy) / all_accuracy
print('相对accuracy下降:', round(relative_accuracy_decrease, 3), '%.')
relative_runtime_decrease = 100 * (all_features_time - reduced_features_time) / all_features_time
print('相对时间效率提升:', round(relative_runtime_decrease, 3), '%.')
通常我们买东西都会考虑性价比,这里同样也是这个问题,时间效率的提升相对更大一些,而且基本保证了模型效果是差不多的。 最后让我们把所有的实验结果汇总到一起来进行对比吧:
# Pandas is used for data manipulation
import pandas as pd
# Read in data as pandas dataframe and display first 5 rows
original_features = pd.read_csv('data/temps.csv')
original_features = pd.get_dummies(original_features)
# Use numpy to convert to arrays
import numpy as np
# Labels are the values we want to predict
original_labels = np.array(original_features['actual'])
# Remove the labels from the features
# axis 1 refers to the columns
original_features= original_features.drop('actual', axis = 1)
# Saving feature names for later use
original_feature_list = list(original_features.columns)
# Convert to numpy array
original_features = np.array(original_features)
# Using Skicit-learn to split data into training and testing sets
from sklearn.model_selection import train_test_split
# Split the data into training and testing sets
original_train_features, original_test_features, original_train_labels, original_test_labels = train_test_split(original_features, original_labels, test_size = 0.25, random_state = 42)
# Find the original feature indices
original_feature_indices = [feature_list.index(feature) for feature in
feature_list if feature not in
['ws_1', 'prcp_1', 'snwd_1']]
# Create a test set of the original features
original_test_features = test_features[:, original_feature_indices]
# Time to train on original data set (1 year)
original_features_time = []
# Do 10 iterations and take average for all features
for _ in range(10):
start_time = time.time()
rf.fit(original_train_features, original_train_labels)
original_features_predictions = rf.predict(original_test_features)
end_time = time.time()
original_features_time.append(end_time - start_time)
original_features_time = np.mean(original_features_time)
# Calculate mean absolute error for each model
original_mae = np.mean(abs(original_features_predictions - test_labels))
exp_all_mae = np.mean(abs(all_features_predictions - test_labels))
exp_reduced_mae = np.mean(abs(reduced_features_predictions - test_labels))
# Calculate accuracy for model trained on 1 year of data
original_accuracy = 100 * (1 - np.mean(abs(original_features_predictions - test_labels) / test_labels))
# Create a dataframe for comparison
model_comparison = pd.DataFrame({'model': ['original', 'exp_all', 'exp_reduced'],
'error (degrees)': [original_mae, exp_all_mae, exp_reduced_mae],
'accuracy': [original_accuracy, all_accuracy, reduced_accuracy],
'run_time (s)': [original_features_time, all_features_time, reduced_features_time]})
# Order the dataframe
model_comparison = model_comparison[['model', 'error (degrees)', 'accuracy', 'run_time (s)']]
model_comparison
# 绘图来总结把
# 设置总体布局,还是一整行看起来好一些
fig, (ax1, ax2, ax3) = plt.subplots(nrows=1, ncols=3, figsize = (16,5), sharex = True)
# X轴
x_values = [0, 1, 2]
labels = list(model_comparison['model'])
plt.xticks(x_values, labels)
# 字体大小
fontdict = {'fontsize': 18}
fontdict_yaxis = {'fontsize': 14}
# 预测温度和真实温度差异对比
ax1.bar(x_values, model_comparison['error (degrees)'], color = ['b', 'r', 'g'], edgecolor = 'k', linewidth = 1.5)
ax1.set_ylim(bottom = 3.5, top = 4.5)
ax1.set_ylabel('Error (degrees) (F)', fontdict = fontdict_yaxis);
ax1.set_title('Model Error Comparison', fontdict= fontdict)
# Accuracy 对比
ax2.bar(x_values, model_comparison['accuracy'], color = ['b', 'r', 'g'], edgecolor = 'k', linewidth = 1.5)
ax2.set_ylim(bottom = 92, top = 94)
ax2.set_ylabel('Accuracy (%)', fontdict = fontdict_yaxis);
ax2.set_title('Model Accuracy Comparison', fontdict= fontdict)
# 时间效率对比
ax3.bar(x_values, model_comparison['run_time (s)'], color = ['b', 'r', 'g'], edgecolor = 'k', linewidth = 1.5)
ax3.set_ylim(bottom = 0, top = 1)
ax3.set_ylabel('Run Time (sec)', fontdict = fontdict_yaxis);
ax3.set_title('Model Run-Time Comparison', fontdict= fontdict);
# original代表是我们的老数据,也就是量少特征少的那份;exp_all代表我们的完整新数据;exp_reduced代表我们按照95%阈值选择的部分重要特征数据集。结果也是很明显的,数据量和特征越多,效果会提升一些,但是时间效率也会有所下降。
三、算法参数选择和调优
3.1 老数据
# Pandas is used for data manipulation
import pandas as pd
# Read in data as a dataframe
features = pd.read_csv('data/temps_extended.csv')
# One Hot Encoding
features = pd.get_dummies(features)
# Extract features and labels
labels = features['actual']
features = features.drop('actual', axis = 1)
# List of features for later use
feature_list = list(features.columns)
# Convert to numpy arrays
import numpy as np
features = np.array(features)
labels = np.array(labels)
# Training and Testing Sets
from sklearn.model_selection import train_test_split
train_features, test_features, train_labels, test_labels = train_test_split(features, labels,
test_size = 0.25, random_state = 42)
print('Training Features Shape:', train_features.shape)
print('Training Labels Shape:', train_labels.shape)
print('Testing Features Shape:', test_features.shape)
print('Testing Labels Shape:', test_labels.shape)
print('{:0.1f} years of data in the training set'.format(train_features.shape[0] / 365.))
print('{:0.1f} years of data in the test set'.format(test_features.shape[0] / 365.))
3.2 还是选择那6个重要性比较高的特征
# Names of five importances accounting for 95% of total importance
important_feature_names = ['temp_1', 'average', 'ws_1', 'temp_2', 'friend', 'year']
# Find the columns of the most important features
important_indices = [feature_list.index(feature) for feature in important_feature_names]
# Create training and testing sets with only the important features
important_train_features = train_features[:, important_indices]
important_test_features = test_features[:, important_indices]
# Sanity check on operations
print('Important train features shape:', important_train_features.shape)
print('Important test features shape:', important_test_features.shape)
# Use only the most important features
train_features = important_train_features[:]
test_features = important_test_features[:]
# Update feature list for visualizations
feature_list = important_feature_names[:]
# 调节新参数 打印
from sklearn.ensemble import RandomForestRegressor
rf = RandomForestRegressor(random_state = 42)
from pprint import pprint
# 打印所有参数
pprint(rf.get_params())
3.3 开始尝试各种参数
调参路漫漫,参数的可能组合结果实在太多了,我们还得有章可循,首先登场的是:RandomizedSearchCV(),这个函数可以帮助我们在候选集组合中,不断的随机选择一组合适的参数来建模,并且求其交叉验证后的评估结果。为什么要不断随机的选择呢?按顺序一个个来不是更靠谱嘛,假设咱们有5个参数待定,每个参数都有10种候选值,那一共有多少种可能性呢?这个数字就很大了吧,由于建立模型所花的时间并不少,当数据量大的时候,几小时能完成一次建模就已经不错了,所以我们很难遍历到所有的可能,随机变成了一种策略,让我们大致能得到比较合适的参数组合,该函数所需的所有参数解释都在API文档中有详细说明.
from sklearn.model_selection import RandomizedSearchCV
# 建立树的个数
n_estimators = [int(x) for x in np.linspace(start = 200, stop = 2000, num = 10)]
# 最大特征的选择方式
max_features = ['auto', 'sqrt']
# 树的最大深度
max_depth = [int(x) for x in np.linspace(10, 20, num = 2)]
max_depth.append(None)
# 节点最小分裂所需样本个数
min_samples_split = [2, 5, 10]
# 叶子节点最小样本数,任何分裂不能让其子节点样本数少于此值
min_samples_leaf = [1, 2, 4]
# 样本采样方法
bootstrap = [True, False]
# Random grid
random_grid = {'n_estimators': n_estimators,
'max_features': max_features,
'max_depth': max_depth,
'min_samples_split': min_samples_split,
'min_samples_leaf': min_samples_leaf,
'bootstrap': bootstrap}
在这个任务中,我们只给大家举例来进行说明,考虑到时间问题,所选的参数的候选值并没有给出太多。这里值得注意的是每一个候选参数的参数空间需要我们好好把控,因为如果这个取值范围给定的不恰当,最好的结果肯定也不会太好,这里可以参考一些经验值或者不断通过实验结果来改变参数空间,这是一个反复的过程,并不是说我们机器学习建模任务就是从前往后的进行,有了实验结果之后,都需要再回过头来反复来对比不同参数,不同预处理方案的。
# 随机选择最合适的参数组合
rf = RandomForestRegressor()
rf_random = RandomizedSearchCV(estimator=rf, param_distributions=random_grid,
n_iter = 100, scoring='neg_mean_absolute_error',
cv = 3, verbose=2, random_state=42, n_jobs=-1)
# 执行寻找操作
rf_random.fit(train_features, train_labels)
rf_random.best_params_
这里给大家解释一下RandomizedSearchCV中常用的参数,其实在API文档中都给出了说明,还是建议大家养成这个查阅文档的习惯。
Estimator:RandomizedSearchCV这个方法是一个通用的,并不是专为随机森林设计的,所以我们需要指定选择的算法模型是什么。
Distributions:参数的候选空间,我们之间已经用字典格式给出了所需的参数分布。
n_iter:随机寻找参数组合的个数,比如在这里我们赋值了100代表接下来要随机找100组参数的组合,在其中找到最好的一个。
Scoring:评估方法,按照该方法去找到最好的参数组合
Cv:交叉验证,咱们之前已经唠过了。
Verbose:打印信息的数量,看自己的需求了。
random_state:随机种子,为了使得咱们的结果能够一致,排除掉随机成分的干扰,一般我们都会指定成一个值,用你自己的幸运数字就好。
n_jobs:多线程来跑这个程序,如果是-1就会用所有的,但是可能会有点卡。
即便我把n_jobs设置成了-1,程序运行的还是很慢,因为我们建立100次模型来选择参数,并且还是带有3折交叉验证的,那就相当于300个任务了,结果如下图所示:
3.4 评估函数
接下来就对比一下,经过调参后的结果和用默认参数结果的差异,所有默认参数在API中都有说明,比如n_estimators : integer, optional (default=10),这里就说明在随机森林模型中,默认要建立树的个数是10个。先给出评估标准:
def evaluate(model, test_features, test_labels):
predictions = model.predict(test_features)
errors = abs(predictions - test_labels)
mape = 100 * np.mean(errors / test_labels)
accuracy = 100 - mape
print('平均气温误差.',np.mean(errors))
print('Accuracy = {:0.2f}%.'.format(accuracy))
# 老模型
base_model = RandomForestRegressor( random_state = 42)
base_model.fit(train_features, train_labels)
evaluate(base_model, test_features, test_labels)
# 新配方(最好的参数)
best_random = rf_random.best_estimator_
evaluate(best_random, test_features, test_labels)
3.5 Grid Search 再来微调
from sklearn.model_selection import GridSearchCV
# 网络搜索
param_grid = {
'bootstrap': [True],
'max_depth': [8,10,12],
'max_features': ['auto'],
'min_samples_leaf': [2,3, 4, 5,6],
'min_samples_split': [3, 5, 7],
'n_estimators': [800, 900, 1000, 1200]
}
# 选择基本算法模型
rf = RandomForestRegressor()
# 网络搜索
grid_search = GridSearchCV(estimator = rf, param_grid = param_grid,
scoring = 'neg_mean_absolute_error', cv = 3,
n_jobs = -1, verbose = 2)
# 执行搜索
grid_search.fit(train_features, train_labels)
grid_search.best_params_
best_grid = grid_search.best_estimator_
evaluate(best_grid, test_features, test_labels)
3.6 另一组参赛选手 Grid Search
# 经过了再调整之后我们的算法模型效果又有了一点提升,虽然只是一小点,但是把每一小步累计在一次就是一个大成绩了。再用网络搜索的时候,遍历的次数太多,我们通常并不把所有的可能性都放进去,而是分成不同的组来分别执行,下面我们再来看看另外一组网络搜索的参赛选手:
param_grid = {
'bootstrap': [True],
'max_depth': [12, 15, None],
'max_features': [3, 4,'auto'],
'min_samples_leaf': [5, 6, 7],
'min_samples_split': [7,10,13],
'n_estimators': [900, 1000, 1200]
}
# 选择算法模型
rf = RandomForestRegressor()
# 继续寻找
grid_search_ad = GridSearchCV(estimator = rf, param_grid = param_grid,
scoring = 'neg_mean_absolute_error', cv = 3,
n_jobs = -1, verbose = 2)
grid_search_ad.fit(train_features, train_labels)
grid_search_ad.best_params_
best_grid_ad = grid_search_ad.best_estimator_
evaluate(best_grid_ad, test_features, test_labels)
3.7 最终模型
print('最终模型参数:\n')
pprint(best_grid_ad.get_params())
来总结一下我们的调参任务吧:
1.参数空间是非常重要的,它会对结果产生决定性影响,所以在开始任务之前,得选择大致一个合适区间,可以参考一些相同任务论文的经验值。
2.随机搜索可以更节约时间,尤其是在任务开始阶段,我们并不知道哪一个参数在哪一个位置效果能更好,这样我们可以把参数间隔设置的更大一些,先用随机搜索确定一些大致位置。
3.网络搜索相当于地毯式搜索了,当我们得到了大致位置之后,想在这里寻找到最优参数的时候就派上用场了,可以把随机和网络搜索当做一套组合拳,搭配使用。
4.最后调参的方法其实还有很多的,比如贝叶斯优化,这个还是蛮有意思的,跟大家简单说一下,想一想我们之前的调参方式,是不是每一个都是独立的进行不会对之后的结果产生任何影响,贝叶斯优化的基本思想在于每一个优化都是在不断积累经验,这样我会慢慢得到最终的解应当在的位置,相当于前一步结果会对后面产生影响了,如果大家对贝叶斯优化感兴趣,可以参考下Hyperopt工具包,用起来也很简便:
来源:oschina
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