homebrew

安装 homebrew /usr/bin/ruby -e "$(curl -fsSL https://raw.githubusercontent.com/Homebrew/install/master/install)" 安装指定的软件包(以 wget 为例) $ brew install wget 删除指定的软件包(以 wget 为例) $ brew uninstall wget 列出当前安装的软件 $ brew list 查询相关软件的信息（日期、出处、依赖库、安装时） $ brew info wgeteagledembp:~ eagle$ brew info wget wget: stable 1.19.5 (bottled), HEAD Internet file retriever https://www.gnu.org/software/wget/ /usr/local/Cellar/wget/1.19.5 (50 files, 3.7MB) * Poured from bottle on 2018-09-07 at 17:07:02 From: https://github.com/Homebrew/homebrew-core/blob/master/Formula/wget.rb ==> Dependencies Build: pkg-config ✘

安装必需软件 Homebrew Homebrew , Mac系统的包管理器，用于安装NodeJS和一些其他必需的工具软件。 /usr/bin /ruby -e "$(curl -fsSL https:/ /raw.githubusercontent.com/Homebrew /install/master /install)" homebrew在安装软件时可能会碰到 /usr/local 目录不可写的权限问题。可以使用下面的命令修复： sudo chown -R `whoami` /usr/ local Node 使用Homebrew来安装 Node.js . brew install node 注意有坑：查看安装的node是否最新版本，默认安装的不是最新版本（我以为默认给我了最新（v8.00），其实默认只给我安装了v4.0.0，v4.0.0不支持ES6，当下面用react-native init <Project> 时会报语法错误 解决方法： 1、安装完node后使用命令查看当前版本 node -v 2、然后查看最新版本 npm info node 3、升级node 清除node.js的cache: sudo npm cache clean -f 安装n工具，n是专门是管理node.js版本的 sudo npm install -g n 安装最新node版本 sudo n

在第4节开始之前，先来一段插曲。在上一节中，我们说到可以使用Trimmomatic、sickle、seqtk或者SOAPnuke对fastq数据进行过滤。那么也许你会好奇，那他们都有什么特点，都一样好吗或是有哪些差异之处？正所谓，工欲善其事必先利其器，所以这篇文章将会与你一起来解开这几个问题。 因为Trimmomatic的安装已经在 第3节 数据质控 中说的比较清楚了，这里就不再赘述。那么， 先说SOAPnuke的安装，你有两种方式： 第一，确保你的系统中有automake。由于SOAPnuke还使用了多个第三方的c++ 程序库，包括 但不限于 ： boost，log4cplus和openssl。因此，需要在你的系统中先安装好这几个库，并修改SOAPnuke代码包的CMakeLists.txt，重新指定里面这几个程序包的路径。同时还需要把上述包的include目录链接到CMakeList.txt中指定的目录（或者你也可以修改到其他目录）下。此外，如果上述三个包的静态库没在默认路径下，那么。。。你还得找到它们，然后修改路径，并涉及到少量代码的修改，再进行编译，然后祈祷。。。至于第三方程序库的安装方法都可以在网上找到。但特别指出一点，建议使用源码安装（特别是log4cplus），防止有些包默认不产生静态链接库。另外，版本不对也会报各种error，包括编译器的error