conda

1、更换python源 　　 mkdir ~/ .pip cd ~/ .pip vi pip.conf 　　vi编辑内容如下: [ global ] index -url=https: // pypi.tuna.tsinghua.edu.cn/simple [install] trusted-host= pypi.tuna.tsinghua.edu.cn disable -pip-version-check = true timeout = 6000 --------------------- 作者：ke1th 来源：CSDN 原文：https: // blog.csdn.net/u012436149/article/details/66974668 版权声明：本文为博主原创文章，转载请附上博文链接！ 上述内容中这一段是可选操作 [install] trusted-host= pypi.tuna.tsinghua.edu.cn disable-pip-version-check = true timeout = 6000 　　下面是python常用的国内镜像 新版ubuntu要求使用https源，要注意。 清华：https: // pypi.tuna.tsinghua.edu.cn/simple 阿里云：http: // mirrors.aliyun.com/pypi/simple

Jupyter Notebook （此前被称为 IPython notebook）是一个交互式笔记本，支持运行 40 多种编程语言。Jupyter Notebook 的本质是一个 Web 应用程序，便于创建和共享文学化程序文档，支持实时代码，数学方程，可视化和 markdown。 用途包括：数据清理和转换，数值模拟，统计建模，机器学习等等 。 更新pip:pip3 install --upgrade pip 安装：pip3 install jupyter 启动：jupyter notebook anaconda anaconda指的是一个开源的Python发行版本，其包含了conda、Python等180多个科学包及其依赖项。 [1] 因为包含了大量的科学包，Anaconda 的下载文件比较大（约 515 MB），如果只需要某些包，或者需要节省带宽或存储空间，也可以使用Miniconda这个较小的发行版（仅包含conda和 Python）。 来源： oschina 链接： https://my.oschina.net/u/3129770/blog/3039041

Python科学计算环境conda的下载 Conda官方主页: https://github.com/conda/conda Conda官方下载地址: Conda官方下载 我是x86_64 linux系统，所以下载 https://repo.continuum.io/miniconda/Miniconda2-latest-Linux-x86_64.sh conda的安装 bash Miniconda3-latest-Linux-x86_64.sh 注意：安装完成后，conda下的bin文件会添加到环境变量里面，这时候需要source一下bash文件 source ~/.bashrc conda的卸载 rm -rf ~/miniconda 并修改~/.bash_profile中的环境变量，去除家目录中隐藏的.condarc文件.conda文件和.continuum目录 rm -rf ~/.condarc ~/.conda ~/.continuum conda的使用 1.查看已经安装的包 conda list 2.查看可用软件包 conda search 3.在 conda 环境中安装 Jupyter notebook，请使用: conda install jupyter notebook 4.也可以通过 pip 来获得 Jupyter notebook pip install

欢迎关注”生信修炼手册”! channels是conda下载包的镜像网站，通过如下命令可以查看已有的channels conda config --show channels channel s: - http s: //mirrors.tuna.tsinghua.edu. cn /anaconda/pkgs/free/ - http s: //mirrors.tuna.tsinghua.edu. cn /anaconda/pkgs/main/ - http s: //mirrors.tuna.tsinghua.edu. cn /anaconda/cloud/conda-forge/ - http s: //mirrors.tuna.tsinghua.edu. cn /anaconda/cloud/bioconda/ - http s: //mirrors.tuna.tsinghua.edu. cn /anaconda/cloud/menpo/ - http s: //mirrors.tuna.tsinghua.edu. cn /anaconda/cloud/msys2/ - defaults 以清华的镜像为例 >https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/pkgs/free/ 每个url对应的是不同操作系统平台的文件夹

# 查看已安装的python包 conda list # 查看当前有哪些虚拟环境 conda env list 或者 conda info - e # 更新conda conda update conda # 创建python虚拟环境 conda create -n your_env_name python=3.6 # 使用python虚拟环境 conda activate jupyterNote # 退出python虚拟环境 conda deactivate # 删除所有虚拟环境 conda remove -n 虚拟环境名称 -- all # 删除环境中某一个安装包 conda remove --name 虚拟环境名称 package_name 来源： oschina 链接： https://my.oschina.net/u/4361298/blog/3491612