2019年主流测序仪参数对比
大浪淘沙，好多基因测序仪厂家已经被历史的车轮甩在了滚滚红尘里，还余下几家大的公司屹立在市场上，有的正在垄断市场（Illumina），有的是正在急速掘起的翘楚(Oxford Nanopore, Pacbio)，还有的是国产的希望(华大智造)。今天，让我们来再看一下它们主流机器的参数，来对比下机器的性能。
华大智造
在“川建国”同志的大棒下，贸易摩擦日益严重的今天，有必要支持一下国产测序仪，虽然不确定里面进口原器件占多少比例，至少它在今天还能为我们所用。听闻和Illumina已经开始诉讼大战，不知这一场该如何收场。虽然华大没有长读长的测序技术平台，不过我看到，其开发的和10X Genomics 超长Linked-Reads相媲美的技术（stLFR，）可以曲线实现读长的增长，虽然依然存在GC偏好性问题。在基因测序仪的认证方面，华大走在了前面，医院的应用正在增长，期待未来华大给我们更多的惊喜。
下面来看下华大的测序仪的性能信息：
来源，华大智造官网（https://www.mgitech.cn/product/sequencer.html ）
Illumina & PacBio
Illumina已经收购了PacBio，成为兼有长短读长的公司，后面把两个产品结合在一起，继续垄断市场的节奏。发现好多技术和产品初创于英国，比如创始于剑桥的Solexa(Illumina测序技术的源头)，Sanger测序和PacBio，ARM，最后却又被美国公司把技术发扬光大。
数据来源，illumina官网（https://www.illumina.com.cn/systems/sequencing-platforms.html ）。可以看出，相比华大平台，Ilumina平台可以实现更长读长250PE，用于测16S等微生物样本具有一定优势。
PacBio平台，Sequel II平台运行CLR (continuous long read)文库，采用10h的运行时间，单张芯片平均产出高达75Gb；
而运行Hifi文库 (highly accurate long reads)，采用30h的运行时间，单张芯片平均产出高达250Gb，较前一代Sequel平台有显著提升，据说准确度也有所提升。
Oxford Nanopore
nanopore正在逐渐提高准确性，包括使用不同的建库方法和测两次的方法，以及不同版本的芯片混合使用，使测序精度达到95%+。
资料来源，官网（https://nanoporetech.com/cn/products/comparison ）。
Thermo Ion Torrent
Ion Torrent作为一家半导体测序技术的独苗，号称是准三代测序，可是由于其对多聚碱基的测序准确度太差，一般只有科研院所的特殊需求在使用。
