GIScript2015-开放地理空间信息处理与分析Python库
GIScript是一个开放的地理空间心处理与分析Python框架,GIS内核采用SuperMap UGC封装,集成多种开源软件,也可以使用其它的商业软件引擎。
by wangerqi@supermap.com, 2016-05-03。
本文档介绍GIScript的安装和配置,并进行简单的运行测试,以确认安装的软件正常运行。
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本教程基于Anaconda3+python3.5.1科学计算环境,请参考:http://www.anaconda.org 。
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本Notebook在Ubuntu 14.04/15.10/16.04运行通过,在本地服务器和阿里云服务器都可以运行。
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本文档使用Jupyter Notebook制作,可以在NBViewer上直接访问和下载本文档。
(一)安装与配置
GIScript的安装包括系统库的设置、UGC Runtime设置和Python库的设置,通过编写一个启动脚本,可以在给定环境下载入相应的运行库的路径。
1、下载GIScript支持库:
cd /home/supermap/GISpark
git clone https://github.com/supergis/GIScriptLib.git
2、UGC系统库的版本适配。
由于GIScript的几个编译库版本较新,在默认使用系统老版本库时部分函数找不到会引起调用失败,因此需要将这几个的系统调用指向到GIScript编译使用的的新版本。在Ubuntu上,具体操作包括:
cd ~/anaconda3/envs/GISpark/lib
mv libstdc++.so libstdc++.so.x
mv libstdc++.so.6 libstdc++.so.6.x
mv libsqlite3.so.0 libsqlite3.so.0.x
mv libsqlite3.so libsqlite3.so.x
mv libgomp.so.1.0.0 libgomp.so.1.0.0.x
mv libgomp.so.1 libgomp.so.1.x
mv libgomp.so libgomp.so.x
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可以运行GIScriptLib/lib-giscript-x86-linux64/下的setup-giscript.sh来自动处理(请根据自己的目录布局修改路径)。
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由于不同系统安装的软件和版本不同,如果还有其它的动态库冲突,可以使用ldd *.so来查看库的依赖关系,按照上述办法解决。
3、安装Python的支持库。
GIScript的Python封装库,默认存放在系统目录:/usr/lib/python3/dist-packages/PyUGC
使用Anaconda时,存在相应的env的目录下,如:[/home/supermap/Anaconda3]/envs/GISpark/lib/python3.5/site-packages
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安装方法一:链接。在[...]/python3.5/site-packages下建立PyUGC的软连接。注意,原文件不可删除,否则就找不到了。
ln -s -f /home/supermap/GISpark/GIScriptLib/lib-giscript-x86-linux64/lib ~/anaconda3/envs/GISpark/lib/python3.5/site-packages/PyUGC
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安装方法二:复制。将lib-giscript-x86-linux64/lib(Python的UGC封装库)复制为Python下的site-packages/PyUGC目录,如下:
cd /home/supermap/GISpark/GIScriptLib cp -r lib-giscript-x86-linux64/lib ~/anaconda3/envs/GISpark/lib/python3.5/site-packages/PyUGC
4、Jupyter启动之前,设置GIScript运行时 library 载入的路径:
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编写脚本,启动前设置GIScript的运行时动态库路径,内容如下:
echo "Config GIScript2016..."
# 使用GIScript2015的开发工程目录,配置示例:
# export SUPERMAP_HOME=/home/supermap/GIScript/GIScript2015/Linux64-gcc4.9
# 使用GIScriptLib运行时动态库,配置如下:
export SUPERMAP_HOME=/home/supermap/GISpark/GIScriptLib/lib-giscript-x86-linux64
export LD_LIBRARY_PATH=$SUPERMAP_HOME/Bin:$LD_LIBRARY_PATH
echo "Config: LD_LIBRARY_PATH="$LD_LIBRARY_PATH
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将上面的内容与Jupyter启动命令放到start.sh脚本中,如下:
echo "Activate conda enviroment GISpark ..."
source activate GISpark
echo "Config GIScript 2016 for Jupyter ..."
export SUPERMAP_HOME=/home/supermap/GISpark/GIScriptLib/lib-giscript-x86-linux64
export LD_LIBRARY_PATH=$SUPERMAP_HOME/bin:/usr/lib/x86_64-linux-gnu/:$LD_LIBRARY_PATH
echo "Config: LD_LIBRARY_PATH="$LD_LIBRARY_PATH
echo "Start Jupyter notebook"
jupyter notebook
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修改start.sh执行权限,运行Jupyter Notebook。
sudo chmod +x start.sh ./start.sh
默认配置下,将会自动打开浏览器,就可以开始使用Jupyter Notebook并调用GIScript的库了。
如果通过服务器使用,需要使用`jupyter notebook --generate-config`创建配置文件,然后进去修改参数,这里不再详述。
(二)运行测试,导入一些数据。
1、导入GIScript的Python库。
from PyUGC import *
from PyUGC.Stream import UGC
from PyUGC.Base import OGDC
from PyUGC import Engine
from PyUGC import FileParser
from PyUGC import DataExchange
import datasource
2、使用Python的help(...)查看库的元数据信息获得帮助。
#help(UGC)
#help(OGDC)
#help(datasource)
3、设置测试数据目录。
import os
basepath = os.path.join(os.getcwd(),"../data")
print("Data path: ", basepath)
file1 = basepath + u"/Shape/countries.shp"
print("Data file: ", file1)
file2 = basepath + u"/Raster/astronaut(CMYK)_32.tif"
print("Data file: ", file2)
file3 = basepath + u"/Grid/grid_Int32.grd"
print("Data file: ", file3)
datapath_out = basepath + u"/GIScript_Test.udb"
print("Output UDB: ",datapath_out)
Data path: /home/supermap/GISpark/git_notebook/geospatial/giscript/../data
Data file: /home/supermap/GISpark/git_notebook/geospatial/giscript/../data/Shape/countries.shp
Data file: /home/supermap/GISpark/git_notebook/geospatial/giscript/../data/Raster/astronaut(CMYK)_32.tif
Data file: /home/supermap/GISpark/git_notebook/geospatial/giscript/../data/Grid/grid_Int32.grd
Output UDB: /home/supermap/GISpark/git_notebook/geospatial/giscript/../data/GIScript_Test.udb
4、导入数据的测试函数。
def Import_Test():
print("Export to UDB: ",datapath_out)
ds = datasource.CreateDatasource(UGC.UDB,datapath_out)
datasource.ImportVector(file1,ds)
datasource.ImportRaster(file2,ds)
datasource.ImportGrid(file3,ds)
ds.Close()
del ds
print("Finished.")
5、运行这个测试。
try:
Import_Test()
except Exception as ex:
print(ex)
Export to UDB: /home/supermap/GISpark/git_notebook/geospatial/giscript/../data/GIScript_Test.udb
创建数据源成功!!
Import Vector: /home/supermap/GISpark/git_notebook/geospatial/giscript/../data/Shape/countries.shp
数据导入成功:Import Vector /home/supermap/GISpark/git_notebook/geospatial/giscript/../data/Shape/countries.shp
Import Raster: /home/supermap/GISpark/git_notebook/geospatial/giscript/../data/Raster/astronaut(CMYK)_32.tif
数据导入成功:Import Image /home/supermap/GISpark/git_notebook/geospatial/giscript/../data/Raster/astronaut(CMYK)_32.tif
Import Grid: /home/supermap/GISpark/git_notebook/geospatial/giscript/../data/Grid/grid_Int32.grd
数据导入成功:Import Grid /home/supermap/GISpark/git_notebook/geospatial/giscript/../data/Grid/grid_Int32.grd
Finished.
(三)查看生成的数据源文件UDB。
下面使用了IPython的Magic操作符 !,可以直接运行操作系统的Shell命令行。
!ls -l -h ../data/GIScript_Test.*
-rw-rw-r-- 1 supermap supermap 5.6M 5月 4 09:46 ../data/GIScript_Test.udb
-rw-r--r-- 1 supermap supermap 74K 5月 4 09:46 ../data/GIScript_Test.udd
删除生成的测试文件。注意,不要误删其它文件!
如果重复运行上面的Import_Test()将会发现GIScript_Test.udb和GIScript_Test.udd文件会不断增大。
但是打开UDB文件却只有一份数据,为什么呢?
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因为UDB文件是增量存储的,不用的存储块需要使用SQLlite的存储空间紧缩处理才能回收。
!rm ../data/GIScript_Test.*
再次查看目录,文件是否存在。
!ls -l -h ../data/GIScript_Test.*
-rw-rw-r-- 1 supermap supermap 12M 5月 4 09:44 ../data/GIScript_Test.udb
-rw-r--r-- 1 supermap supermap 122K 5月 4 09:44 ../data/GIScript_Test.udd
来源:oschina
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