大家都熟悉文件系统，在对HDFS进行分析前，我们并没有花很多的时间去介绍HDFS的背景，毕竟大家对文件系统的还是有一定的理解的，而且也有很好的文档。在分析Hadoop的MapReduce部分前，我们还是先了解系统是如何工作的，然后再进入我们的分析部分。下面的图来自http://horicky.blogspot.com/2008/11/hadoop-mapreduce-implementation.html，是我看到的讲MapReduce最好的图。
以Hadoop带的wordcount为例子（下面是启动行）：
hadoop jar hadoop-0.19.0-examples.jar wordcount /usr/input/usr/output
用户提交一个任务以后，该任务由JobTracker协调，先执行Map阶段（图中M1，M2和M3），然后执行Reduce阶段（图中R1和R2）。Map阶段和Reduce阶段动作都受TaskTracker监控，并运行在独立于TaskTracker的Java虚拟机中。
我们的输入和输出都是HDFS上的目录（如上图所示）。输入由InputFormat接口描述，它的实现如ASCII文件，JDBC数据库等，分别处理对于的数据源，并提供了数据的一些特征。通过InputFormat实现，可以获取InputSplit接口的实现，这个实现用于对数据进行划分（图中的splite1到splite5，就是划分以后的结果），同时从InputFormat也可以获取RecordReader接口的实现，并从输入中生成<k,v>对。有了<k,v>，就可以开始做map操作了。
map操作通过context.collect（最终通过OutputCollector. collect）将结果写到context中。当Mapper的输出被收集后，它们会被Partitioner类以指定的方式区分地写出到输出文件里。我们可以为Mapper提供Combiner，在Mapper输出它的<k,v>时，键值对不会被马上写到输出里，他们会被收集在list里（一个key值一个list），当写入一定数量的键值对时，这部分缓冲会被Combiner中进行合并，然后再输出到Partitioner中（图中M1的黄颜色部分对应着Combiner和Partitioner）。
Map的动作做完以后，进入Reduce阶段。这个阶段分3个步骤：混洗（Shuffle），排序（sort）和reduce。
混洗阶段，Hadoop的MapReduce框架会根据Map结果中的key，将相关的结果传输到某一个Reducer上（多个Mapper产生的同一个key的中间结果分布在不同的机器上，这一步结束后，他们传输都到了处理这个key的Reducer的机器上）。这个步骤中的文件传输使用了HTTP协议。
排序和混洗是一块进行的，这个阶段将来自不同Mapper具有相同key值的<key,value>对合并到一起。
Reduce阶段，上面通过Shuffle和sort后得到的<key, (list of values)>会送到Reducer. reduce方法中处理，输出的结果通过OutputFormat，输出到DFS中。
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来源：oschina
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