精心整理(含图版)|你要的全拿走!(R数据分析,可视化,生信实战)

霸气de小男生 提交于 2020-04-19 04:43:24

 

本文首发于“生信补给站”公众号,https://mp.weixin.qq.com/s/ZEjaxDifNATeV8fO4krOIQ更多关于R语言,ggplot2绘图,生信分析的内容,敬请关注小号。

 

为了能更方便的查看,检索,对文章进行了精心的整理。建议收藏,各取所需,当前没用也许以后就用到了呢!

 

一 R资料+计划

R语言精品资料年中无套路赠送

R-plotly|交互式甘特图(Gantt chart)-项目管理/学习计划

 

二 Bioinfo

R|fastqcr QC数据处理 :测序结果的数据质控及图标展示;

Bioinfo|bedtools-操作VCF文件 VCF文件的常见合并,过滤等操作;

 

R|生存分析(1) :生存分析介绍以及R实现,KM绘图;

R|生存分析-结果整理 :一键式输出所有变量的COX结果;

R|timeROC-分析 :时间依赖的生存分析;

Nomogram(诺莫图) | Logistic、Cox生存分析结果可视化

Forest plot(森林图) | Cox生存分析可视化

R-forestplot包| HR结果绘制森林图

maftools|TCGA肿瘤突变数据的汇总,分析和可视化

maftools | 从头开始绘制发表级oncoplot(瀑布图)

ggalluvial|炫酷桑基图(Sankey),你也可以秀

pheatmap|暴雨暂歇,“热图”来袭!!!

ggplot2-plotly|让你的火山图“活”过来

R|clusterProfiler-富集分析

ggplot2| 绘制KEGG气泡图

ggplot2|绘制GO富集柱形图

ggplot2|从0开始绘制PCA图

Bio|manhattan图

 

 

三 base + ggplot2

R|绘图边距及布局

R-基本绘图参数(Ⅰ)

ggplot2|详解八大基本绘图要素

ggplot2|theme主题设置,详解绘图优化-“精雕细琢”

ggplot2 |legend参数设置,图形精雕细琢

ggplot2|从0开始绘制直方图

ggplot2|从0开始绘制折线图

ggplot2|从0开始绘制箱线图

绘图系列|R-corrplot相关图

绘图系列|R-wordcloud2包绘制词云

绘图系列|R-VennDiagram包绘制韦恩图

ggplot2|发散性“正负”图

R|UpSet-集合可视化

ggplot2|ggpubr进行“paper”组图合并

ggplot2|扩展包从0开始绘制雷达图

R|plotly

 

四 数据分析

R|批量循环处理同一格式文件-csv,txt,excel

R In Action |基本数据管理

数据分析|R-缺失值处理

数据分析|R-异常值处理

数据分析|R-描述性统计

小数据| 描述性统计(Python/R 实现)

数据挖掘|R-相关性分析及检验

数据处理 | R-tidyr包

数据处理|R-dplyr

R|apply,tapply

数据处理|数据框重铸

R|ML_code-入门(1)

R|ML_code-线性回归(2)

R|机器学习入门-多元线性回归(3)

 

五 其他

1,年中定一个小计划,三个系列继续随着学习更新;

2,Python 数据处理和生信应用示例系列;

3,机器学习基础算法应用生信分析实例(R & Python);

 

目标不变,希望能比较持续,系统的学习,输出带动输入!

 

对了,部分文末有代码或者数据的获取方式,看到后按提示回复即可!

 

◆ ◆ ◆ ◆ ◆

【觉得不错,右下角点个“在看”,期待您的转发,谢谢!】

 

原文出处:https://www.cnblogs.com/Mao1518202/p/11839956.html

易学教程内所有资源均来自网络或用户发布的内容,如有违反法律规定的内容欢迎反馈
该文章没有解决你所遇到的问题?点击提问,说说你的问题,让更多的人一起探讨吧!