【python】利用h5py存储数据

寵の児 提交于 2020-03-01 12:23:06

两类容器:group & dataset

group类似文件夹,字典。 dataset是数据集,类似数组

支持更多的对外透明的存储特征,数据压缩,误差检测,分块传输

group下面可以是group,也可以是dataset

只能储存纯粹的数据,不能储存DataFrame, Panel等东西,如果要用使用 to_hdf

 

import h5py

读:

f = h5py.File(file, mode='r')

f.keys()

dset = f['mydataset']

写:

f = h5py.File(file, mode='w')

dset = f.create_dataset(name, dataOrSize, dtype, )

可选项:

chunks: True自动分块, 如果手动分块则输入元组

 

可以对数据块设置attrs

dset.attrs['abc'] = 1

 

高级特性:

滤波器组?加入参数compression = 'gzip'

hdf5文件本身大小没有限制

一个dataSet最多32维, 每个维最多2^64个值

一个chunk最大4G,

 

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