VMD将两个pdb文件和起来作为LAMMPS_data文件

1、在使用VMD 的TOPO 工具中，如何将两个… .pdb分子和起来作为LAMMPS的输入data呢？
2、假设存在两个part.pdb 文件，我们想将它和起来。
step1：
在VMD的命令窗口 TK console 中 输入；
logfile console：在窗口中输出每一步的命令；
这里需要用到TOPO这个工具
在窗口中输入：
package require topotools 1.1
step2：
set midlist {}
set mol [mol new part1.psf waitfor all]
mol addfile part1.pdb
lappend midlist $mol
set mol [mol new part2.psf waitfor all]
mol addfile part2.pdb $mol
lappend midlist $mol
step3：
set mol [::TopoTools::mergemols $midlist]
animate write psf merged.psf $mol ### merged.psf 文件名
animate write pdb merged.pdb $mol
或者可以 :
topo writelammpsdata <filename.data>
final step：
这样就做好了！

来源：CSDN

作者：RockyYoung_2019

链接：https://blog.csdn.net/qq_43689832/article/details/104346978