生物进化

2019/07/28 进化是以族群为单位的，是一个渐变且漫长的过程，需要与多种多样的因素、环境相作用，单独的个体根本无法独自完成这个过程。 生物的进化进程自始至终都是残酷的、血腥的，是有限资源的不停争夺和个体的完全垄断，是没有丝毫温情的相互竞争与野蛮屠戮。整个进程给所有生物的心中留下了永远无法挥去的阴影，即使发展了千年的所谓高级文明也无法完全掩饰其原始的野性:完全以自我为中心的利己主义以及贪得无厌的无限索取和毁灭行为。生存是一种异常残酷的斗争，是弱者与强者之间永恒地角逐。在绝对利益面前，没有善恶是非、贫贱好坏，只有优胜劣汰、适者生存的自然法则。在战争、欺骗、诱惑、奴役、利用、掠夺、诡计等等的洪流之中，传承下来的只会是最适应环境的基因。而所谓文明正是让这些野性更加狂虐肆意的温床，滋生出更多样的竞争手段和取胜的工具。 最终决定进化方向的究竟是群体的积累还是极少数最强悍生物的引领？而我看到的事实是，绝大部分生物只能在这洪流中紧紧跟随前面生物的脚步，踉踉跄跄、复制粘贴。这些大多数没有决定权，Ta们只想活下去，为了生存，可以丢弃一切，因为Ta们看到周围的生物都是这样做的，Ta们不能与众不同。脱离群体的个体要么会成为群体的公敌，要么只能孤独地面对解决所有问题。如果这些个体真的极具能量，以超常的天赋和持久地毅力开辟出一片全新的领域则又可以吸引整个群体蜂拥而来，如蛆附骨

四、基于序列数据的生物进化研究的挑战 解密后由表象进化到分子进化。 构建进化树的步骤： 序列相似性比较---序列同源性比较----构建系统进化树---稳定性检验,因为必须是保守序列。 序列相似性比较。就是将待研究序列与DNA或蛋白质序列库进行比较，用于确定该序列的生物属性，也就是找出与此序列相似的已知序列是什么。完成这一工作只需要使用两两序列比较算法。常用的程序包有BLAST、FASTA等； 序列同源性分析。是将待研究序列加入到一组与之同源，但来自不同物种的序列中进行多序列同时比较，以确定该序列与其它序列间的同源性大小。这是理论分析方法中最关键的一步。完成这一工作必须使用多序列比较算法。常用的程序包有CLUSTAL等； 构建系统进化树。根据序列同源性分析的结果，重建反映物种间进化关系的进化树。为完成这一工作已发展了多种软件包，象PYLIP、MEGA等； 稳定性检验。为了检验构建好的进化树的可靠性，需要进行统计可靠性检验，通常构建过程要随机地进行成百上千次，只有以大概率（70％以上）出现的分支点才是可靠的。通用的方法使用 Bootstrap算法，相应的软件已包括在构建系统进化树所用的软件包当中。为便于使用者查找表三给出了进化分析相关软件的因特网地址。 来源： https://www.cnblogs.com/yuanjingnan/p/11896612.html