全基因组关联分析学习资料（GWAS tutorial）
前言 很多人问我有没有关于全基因组关联分析（GWAS）原理的书籍或者文章推荐。 其实我个人觉得，做这个分析，先从跑流程开始，再去看原理。 为什么这么说呢，因为对于初学者来说，跑流程就像一个大黑洞，学习原理就像一个小黑洞。 很多人花了好几个月的时间在看原理，一旦丢给他数据去分析，依旧束手无策。 不会跑流程，内心依旧会很恐慌。就像从来没有入门一样。 所以，我的建议是咱们先不去管原理，直接从分析入手。 等把数据跑出来了，整个流程的技能点满了，再去看看它的原理。 入门：学习GWAS的在线网站： 对于没有编程基础的人来说，建议先从一个在线的网站走一遍GWAS流程。 这样就能知道完成GWAS需要多少个步骤，心里大概有个底。 easygwas 网站提供了公共数据，可以直接开始分析GWAS。整个流程按照网站提示，很简单。 网址： https://easygwas.ethz.ch/ 进阶备选1：在linux下学习GWAS的实操数据 由于我们最终还是需要拿着自己的数据完成GWAS分析，不必避免的需要一定的编程基础。 在线网站只是一个提供理解GWAS流程的网站，因此，我们还是需要在linux系统下拿一些数据练练手。学会最基本的命令行。 在这里，我推荐一个提供linux下学习GWAS的教程： GWA_tutorial . 网址： https://github.com/MareesAT/GWA