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TIMER+TISIDB分析肿瘤免疫浸润

由 …衆ロ難τιáo~ 提交于 2021-02-17 12:46:51
生 信论文的套路 ONCOMINE从全景、亚型两个维度做表达差异分析； 临床标本从蛋白水平确认（或HPA数据库），很重要； Kaplan-Meier Plotter从临床意义的角度阐明其重要性； cBio-portal数据库做基因组学的分析（机制一）； STRING互作和GO/KEGG分析探讨可能的信号通路（机制二）； TISIDB/TIMER分析肿瘤免疫特征（机制三）。 我们介绍过，TIMER和TISIDB数据库都是做肿瘤免疫浸润分析的神器，但是数据库之间的组合是非常有讲究的。那么，怎样用好肿瘤免疫数据库呢？这篇文章以前分享过，值得重新学习。 影响因子4分+。 文章题目 摘要部分 正文部分。 先 是开源数据与课题组数据结合的情况，在纯生信论文越来越多的背景下，这种数据展示形式会更加普遍。 即使在顶级期刊，这种形式也很多见，也体现研究的科学性，增加数据的可 信 度。 首先是三线图的临床数据，用PPT就可以完成。 GEO数据和TCGA数据的Meta分析，结合HPA数据库的病理染色结果， 从mRNA水平到蛋白水平，该实验结果很有层次感（其实要是再有RT-PCR的实验结果就更好了） 。上述TCGA数据和GEO数据可以通过ONCOMINE数据设定条件，然后筛选出相应的数据，再进行meta分析，数据要用作图软件Graghpad Prism。 基因表达差异与病理分析，存活率之间的相关性

TIMER+TISIDB分析肿瘤免疫浸润

由 孤人 提交于 2021-02-17 12:19:33
生 信论文的套路 ONCOMINE从全景、亚型两个维度做表达差异分析； 临床标本从蛋白水平确认（或HPA数据库），很重要； Kaplan-Meier Plotter从临床意义的角度阐明其重要性； cBio-portal数据库做基因组学的分析（机制一）； STRING互作和GO/KEGG分析探讨可能的信号通路（机制二）； TISIDB/TIMER分析肿瘤免疫特征（机制三）。 我们介绍过，TIMER和TISIDB数据库都是做肿瘤免疫浸润分析的神器，但是数据库之间的组合是非常有讲究的。那么，怎样用好肿瘤免疫数据库呢？这篇文章以前分享过，值得重新学习。 影响因子4分+。 文章题目 摘要部分 正文部分。 先 是开源数据与课题组数据结合的情况，在纯生信论文越来越多的背景下，这种数据展示形式会更加普遍。 即使在顶级期刊，这种形式也很多见，也体现研究的科学性，增加数据的可 信 度。 首先是三线图的临床数据，用PPT就可以完成。 GEO数据和TCGA数据的Meta分析，结合HPA数据库的病理染色结果， 从mRNA水平到蛋白水平，该实验结果很有层次感（其实要是再有RT-PCR的实验结果就更好了） 。上述TCGA数据和GEO数据可以通过ONCOMINE数据设定条件，然后筛选出相应的数据，再进行meta分析，数据要用作图软件Graghpad Prism。 基因表达差异与病理分析，存活率之间的相关性

DataGrid DataGridTemplateColumn ComboBox

由 自作多情 提交于 2021-02-17 05:51:33
问题 I'm having trouble with my ComboBoxes in a DataGrid , let me explain with a few pictures. This is the starting point. Now if I want to add a new row I click the last row and hit Enter. A new row is added and iv selected type table here and given it a name MY_TABLE, then I hit enter to add another row. The result is this, the combobox for the previous added row's type selection has gone back to None. NOTE: that the checkboxes were previously grayed out as type None cant have any privileges,

Prism unity container per module

由 牧云@^-^@ 提交于 2021-02-17 02:38:40
问题 I have two modules in my app, and want to register types for a second module in a separate container. Didn't find any ways to do that. Only way I see now is add prefixes to reusable types like that: var foo1 = new Foo("FOO 1"); parentContainer.RegisterInstance<IFoo>("Foo1", foo1); var foo2 = new Foo("FOO 2"); parentContainer.RegisterInstance<IFoo>("Foo2", foo2); parentContainer.RegisterType<IService1, Service1>(new ContainerControlledLifetimeManager(), new InjectionConstructor(new

前端个人面试真题碾压互联网一线大厂

由 巧了我就是萌 提交于 2021-02-13 02:20:17
1.document.parentNode和document.parentnode document.parentNode -> null （有属性但没有值） document.parentnode -> undefined （没有属性） 如果说当前对象有这个属性，这个属性没有值是null；如果没有这个属性为undefined 2.let vs var区别 1.let没有变量提升（但在词法解析阶段也得知某一个变量是否是私有变量） 2.let不允许在相同的作用域下重复声明 3.let解决了JS中的暂时性死区问题 4.let创建的全局变量没有给window设置对应的属性 5.let会产生块级作用域 … 你理解的闭包是什么，优缺点？ 解释：函数执行会形成一个全新私有作用域，保护里面的变量不收外界的干扰，这种保护机制就是闭包 官方解释： 函数执行会形成一个私有栈内存作用域，函数不销毁，与里面的私有变量不冲突，并且也可以保存下来。 闭包就是保存和保护。保护私有变量与外界没有联系，不收干扰。保存就是保存私有变量不销毁。 标准回答技巧： 1.我封装了一个组件，大量运用了闭包。。。 2.我研究Jquery源码，发现就是闭包保护起来的 3.我在研究react源码，发现rudex就是利用了闭包 优缺点：过多的运用闭包会形成性能上的消耗，所以尽量减少闭包的使用。 3.实现弹出5个索引，说明原理

Multiple DirectoryModuleCatalog in a Prism application

由 倖福魔咒の 提交于 2021-02-10 16:00:56
问题 We have Unity+Prism WPF applications, and there is 2 folders from which we want to load dynamically the modules. I know that to load modules from a directory, I should use a DirectoryModuleCatalog , but the CreateModuleCatalog method allows only one catalog to be returned, so how do I wrap them in one catalog? In my boostrapper, what should I return here: protected override IModuleCatalog CreateModuleCatalog() { new DirectoryModuleCatalog() { ModulePath = @".\Services" }; new

Multiple DirectoryModuleCatalog in a Prism application

由 北城以北 提交于 2021-02-10 15:58:59
问题 We have Unity+Prism WPF applications, and there is 2 folders from which we want to load dynamically the modules. I know that to load modules from a directory, I should use a DirectoryModuleCatalog , but the CreateModuleCatalog method allows only one catalog to be returned, so how do I wrap them in one catalog? In my boostrapper, what should I return here: protected override IModuleCatalog CreateModuleCatalog() { new DirectoryModuleCatalog() { ModulePath = @".\Services" }; new

Communicating across modules with Prism?

由 試著忘記壹切 提交于 2021-02-08 15:25:52
问题 From following the Prism documentation it says there are four ways to communicate across modules - Solution commanding Region context Shared services Event aggregation Can I just chose one of these methods and apply it for all cross-module communcation? Or should I use different methods depending on the situation? In particular, in an application Im writing at the moment I have button in one module and when the user clicks it I want to start a thread in another module. Which method of

Prism 7 throws and exception when working with nested views

由 浪尽此生 提交于 2021-02-05 08:14:14
问题 I posted similar question few months ago Working with nested views using Prism with IsNavigationTarget which can return false, I'm still not sure what is the proper way to do it. Imagine you have a view A, in this view A you have declared a region A, then you injected a view B into this region A. Similarly, in View B you have registered region B, and then you injected a view C into this region B. As it shown on the following picture: In the ViewModelA for ViewA, I have a method SetUpSubViews(

台湾大学《临床试验》公开课，单元10：统计分析（四）

由 佐手、 提交于 2021-01-31 11:18:21
台灣大學《臨床試驗》公開課 视频较长，请在WIFI下或PC上观看 获取课程教辅资料，请回复“ 临床试验 ”。 流行病學與預防醫學研究所 簡國龍、劉仁沛 以臨床試驗研究設計及實際進行時處理的問題作一通盤性的介紹，使學生能對臨床試驗的方法及運用有一整體的認識。介紹臨床試驗的研究方法，以系統性說明臨床試驗過程需注意的內容，使學習者能熟練臨床試驗的步驟，並且 ... 本課程共 13 講，包含： 單元 1 ．課程簡介 單元 2 ．研究設計 ( 一 ) 單元 3 ．研究設計 ( 二 ) 單元 4 ．統計分析 ( 一 ) 指標種類與選擇 單元 5 ．統計分析 ( 二 ) 單元 6 ．藥品優良臨床試驗規範 / 評估臨床試驗品質 單元 7 ．統計分析 ( 三 ) 單元 8 ．不良反應與不良事件 單元 9 ．臨床試驗執行 ( 一 ) 單元 10 ．統計分析 ( 四 ) 單元 11 ．統計分析 ( 五 ) 單元 12 ．臨床試驗執行 ( 二 ) 單元 13 ．臨床試驗執行 ( 三 ) 【一起学统计工具小tips】本公众号有海量的统计学习素材，输入统计专业术语或问题短语（如方差分析、标准差、ROC曲线、偏倚等），可智能检索各种统计文章。如果检索结果不满意，可变换检索的方式，如加长或缩短检索短语的长度等。重要干货和文章，请访问订阅号底部菜单。获取各种学习资料下载，请回复如下关键词：method｜open
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