GWAS ATLAS:最全面的GWAS数据库
欢迎关注”生信修炼手册”! GWAS ATLAS数据库收录了来自4756个人类不同表型的GWAS结果，并进行了不同表型间的遗传相关性分析，对应的文献发表在nature genetics上，链接如下 https://www.nature.com/articles/s41588-019-0481-0 数据库的网址如下 https://atlas.ctglab.nl/ 该数据库不仅仅是一个gwas结果存储的数据库，对于收录的原始gwas结果，进行了深入挖掘，提供了risk loci, LDSC, MAGMA基因集关联分析，多种表型间的遗传相关性分析等结果。 分成了以下3大模块 1. Browse GWAS 查看gwas分析结果，包含了以下几点内容 manhattan plot lead snp and risk loci gene-based association results SNP heritability and genetic correlations GWAS分析最经典的展示结果就是曼哈顿图和QQ图了，示意如下 基于gwas结果，分析了lead snp和risk loci, 结果示意如下 利用MAGMA软件进行了基因集的关联分析，结果示意如下 利用LDSC分析，评估了表型对应的SNP遗传力，结果示意如下 2. Multiple GWAS comparison