长白猪和梅花猪结肠内微生物及微生物代谢差异研究
文章简介 微生物组的热度已经持续几年了，目前热度依旧不减，感觉肠道微生物是一个可以影响机体任何表型的东西。相关研究者称，动物具有两套基因组，一套是父母遗传的，一套是出生后微生物带来的；中医学认为，体质是由先天遗传和后天禀赋共同影响的，先天遗传也就是第一套基因组决定的，后天禀赋就和机体与微生物的互作有关。本次小编介绍的文章是不同品种猪的结肠微生物和细菌代谢物的差异分析，中文题名为“长白猪和梅花猪结肠内微生物及微生物代谢差异研究”。 背景 长白猪是引进的外国猪种，是瘦肉型猪种，梅花猪是中国本地猪，具有脂肪沉积多等特点，作者估计也就想利用微生物组学和代谢组学探究不同品种肠道微生物以及微生物代谢物的差异。 试验动物 以7头长白断奶猪和7头梅花断奶猪为试验对象，均在30日龄断奶，断奶后，在相同的情况下饲喂30天，然后屠宰，收集结肠内容物进行16S测序和代谢物的广筛和进一步靶向筛选，同时收集结肠粘膜进行PCR定量分析，分析一些和代谢物相关的宿主基因表达情况。 试验设计 结果 一、代谢组学分析以及基因定量分析 通过代谢组数据的PCA和OPLS-DA分析；发现相同品种的代谢物数据聚到一起，说明不同品种的样本重复性较好；同时，基于OPLS-DA分析，非靶向代谢物筛选鉴定了401种差异代谢物，在MS/MS 数据库注释到71种具体的差异代谢物。 样品聚类及差异代谢物筛选 在数据库对代谢物功能注释