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1.背景介绍 病原体基因检测，为各种严重感染的诊断提供了基础。病原体检测流程分成五个步骤：（1）采集病人的样本，比方说静脉血，痰液，肺泡灌洗液，或者脑脊髓液等。（2）对样本进行培养，提取样本中的核酸组织。（3）通过高通量基因测序仪，对核酸序列进行测序。高通量测序为了保证精度，会将很长的核苷酸序列，切成小的分片，分别进行测序，在读取基因序列上，一般是50pb到200bp不等。（4）高通量测序之后，需要查询相关的病原体标准序列，找到匹配的基因序列。（5）通过将这些小的片段进行分析，得到全部基因片段的组成成分（即检测结果），从而为病人的疾病确诊以及精准治疗提供有力的支持。 图1. 病原体基因检测流程 对于生物分析检测来说，通常情况下，一次病原体检测，大约会生成5亿左右的75bp的基因片段。过滤掉一些人的基因组织序列之后，还需要查询1亿左右的基因片段。通常情况下，会使用nBlast [1]工具来进行基因匹配，这部分在整个病原体检测过程中，也是非常耗时的部分，大约需要2-3个小时。阿里云AnalyticDB向量版提供了一个高效的基因检索工具，大大提升了基因分析的性能，能够在几十分钟内完成整个病原体的查询检测过程。 2.基因检索应用 2.1 基因检索功能 图1展示了病原体基因检索的界面。当前演示包含了12182个病毒的碱基序列，我们将病毒切分成150bp的小片段（总共1590804个片段）