分子和原子

目录 一、 最美理论 1. 1905年 ，爱因斯坦科学期刊《投了三篇文章》 2. 空间是一种物质 3. 爱因斯坦方程式 4. 黑洞 5. 宇宙大爆炸 二、 量子 1. 普朗克假设 2. 量子理论诞生宣言 3. 量子跃迁 4. 量子理论方程 三、 宇宙的构造 人类宇宙构造的认知历史 四、 粒子 原子组成 粒子理论 五、空间的颗粒 20世纪两大明珠 相互矛盾的伟大理论 圈量子引力 六、概率、时间和黑洞的热 1. 热的本质 2. 黑洞的热 七、我们 一、 最美理论 1. 1905年 ，爱因斯坦科学期刊《投了三篇文章》 第一篇指出了原子的存在 第二篇奠定了量子力学的基础 第三篇提出了《狭义相对论》 狭义相对论对牛顿的万有引力提出了质疑，和自由落体的认知产生了矛盾，爱因斯坦花了十年的时间解决，提出了《广义相对论》 牛顿想像物体是在空间中运动的：所有物体都做直线运动，直到一个力使它们的轨道发生弯曲，至于这个容纳世界的空间是由什么做成的，牛顿没有给出答案。 爱因斯坦出生前的几年，法拉第和麦克斯韦发现了“电磁场”：一种无处不在的真实存在，可以传递无线波，可以振动，波动 爱因斯坦收电磁场启发：引力场不弥漫于空间，因为它本身就是空间。 2. 空间是一种物质 广义相对论对宇宙做出了惊人的简化：空间是构成世界的“物质”之一，这种可以波动、弯曲、变形的实体。 太阳会使其周围的空间发生弯曲

利用人脑或计算机控制氮气激光器复制或传送物质的机器 利用人脑或计算机控制氮气激光器复制或传送物质的机器 技术领域 利用人脑或计算机控制氮气激光器复制或传送物质的机器是一种通过人脑或计算机记录下物质影像后，再根据所记录的影像，使用氮气激光器复制或传送该物质的机器。 背景技术 根据佛法“缘生法无自性，即慧眼所照见的真或空”，这是说一切事物和现象都由亲因、疏缘而生，并无凝固不变的本性，因而在相互关系上是虚通的。又有佛法说“缘生法同一性，即法眼所照见的俗或假”。这是说，假是与实相对而言，有假必有实，假不离实。因缘所生法虽无本身实性，但并非如龟毛兔毛全属虚无，而是对于真如、法性之实法、实有称为假法或假有。说白了，就是佛可以利用自己的思想看透任何事物，同时用自己的思想变幻出任何事物。也就是按照佛理，人的思想是可以把任何东西记录下来，人可以利用记录下来的事物影像来重新创造出一个和原来事物相同的事物。按照科学理论，人的大脑是一个电磁场，它可以扫描一个事物的原子结构，并把这个事物的原子结构记录下来，再利用这个事物的原子结构，利用自己的大脑把这个重现按照原子结构组合起来。如图1所示。 同时人的大脑的电磁场扫描一个事物的原子结构，人再利用大脑把这个事物的原子打散传送到其它地方，再根据记录的这个事物的原子结构重新组合成这个事物。如图2所示。 发明内容 上面的描述就实现了利用大脑复制或传送事物的目的

利用人脑或计算机控制氮气激光器复制或传送物质的机器 利用人脑或计算机控制氮气激光器复制或传送物质的机器 技术领域 利用人脑或计算机控制氮气激光器复制或传送物质的机器是一种通过人脑或计算机记录下物质影像后，再根据所记录的影像，使用氮气激光器复制或传送该物质的机器。 背景技术 根据佛法“缘生法无自性，即慧眼所照见的真或空”，这是说一切事物和现象都由亲因、疏缘而生，并无凝固不变的本性，因而在相互关系上是虚通的。又有佛法说“缘生法同一性，即法眼所照见的俗或假”。这是说，假是与实相对而言，有假必有实，假不离实。因缘所生法虽无本身实性，但并非如龟毛兔毛全属虚无，而是对于真如、法性之实法、实有称为假法或假有。说白了，就是佛可以利用自己的思想看透任何事物，同时用自己的思想变幻出任何事物。也就是按照佛理，人的思想是可以把任何东西记录下来，人可以利用记录下来的事物影像来重新创造出一个和原来事物相同的事物。按照科学理论，人的大脑是一个电磁场，它可以扫描一个事物的原子结构，并把这个事物的原子结构记录下来，再利用这个事物的原子结构，利用自己的大脑把这个重现按照原子结构组合起来。如图1所示。 同时人的大脑的电磁场扫描一个事物的原子结构，人再利用大脑把这个事物的原子打散传送到其它地方，再根据记录的这个事物的原子结构重新组合成这个事物。如图2所示。 发明内容 上面的描述就实现了利用大脑复制或传送事物的目的

　　1 　　元素周期表的最后一列是一类“扫兴”的元素，它们被统称为<strong>惰性气体</strong>。大多数元素的原子会和其他原子共享电子，形成化学键，从而构成分子，而<strong>惰性气体原子的最外层的电子本身已经达到“满”的状态，因此它们自身就极其稳定，很少发生化学反应，很难与其他原子结合形成分子</strong>。 　　在地球上，还没有发现天然形成的惰性气体化合物。从上个世纪开始，科学家就在实验室中尝试将惰性气体的原子合成分子。1925 年，科学家在实验室中设法让氦（He）与氢离子（H?）共享一个电子，合成了第一个<strong>氦合氢离子</strong>（HeH?）。天文学家将氦合氢离子称为“分子”，但由于它并不是电中性的，化学家更愿意称之为“分子离子”。 　　1962 年，化学家<strong>尼尔·巴特利特</strong>（Neil Bartlett）诱导氙（Xe）、氟和铂结合，得到了一个芥黄色的化合物——<strong>六氟合铂酸氙</strong>，这是一个电中性分子，也是第一个电中性的惰性气体化合物分子。 　　但在宇宙中，情况可能大不一样。太空是一个寻找惰性气体化合物分子的绝佳场所。惰性气体元素在宇宙中十分丰富。氦是仅次于氢的宇宙中第二丰富的元素，氖（Ne）的丰度大约排在第五或第六名。在星际空间中，温度和密度时常达到极端情况

　　1 　　元素周期表的最后一列是一类“扫兴”的元素，它们被统称为<strong>惰性气体</strong>。大多数元素的原子会和其他原子共享电子，形成化学键，从而构成分子，而<strong>惰性气体原子的最外层的电子本身已经达到“满”的状态，因此它们自身就极其稳定，很少发生化学反应，很难与其他原子结合形成分子</strong>。 　　在地球上，还没有发现天然形成的惰性气体化合物。从上个世纪开始，科学家就在实验室中尝试将惰性气体的原子合成分子。1925 年，科学家在实验室中设法让氦（He）与氢离子（H?）共享一个电子，合成了第一个<strong>氦合氢离子</strong>（HeH?）。天文学家将氦合氢离子称为“分子”，但由于它并不是电中性的，化学家更愿意称之为“分子离子”。 　　1962 年，化学家<strong>尼尔·巴特利特</strong>（Neil Bartlett）诱导氙（Xe）、氟和铂结合，得到了一个芥黄色的化合物——<strong>六氟合铂酸氙</strong>，这是一个电中性分子，也是第一个电中性的惰性气体化合物分子。 　　但在宇宙中，情况可能大不一样。太空是一个寻找惰性气体化合物分子的绝佳场所。惰性气体元素在宇宙中十分丰富。氦是仅次于氢的宇宙中第二丰富的元素，氖（Ne）的丰度大约排在第五或第六名。在星际空间中，温度和密度时常达到极端情况

　　1 　　元素周期表的最后一列是一类“扫兴”的元素，它们被统称为<strong>惰性气体</strong>。大多数元素的原子会和其他原子共享电子，形成化学键，从而构成分子，而<strong>惰性气体原子的最外层的电子本身已经达到“满”的状态，因此它们自身就极其稳定，很少发生化学反应，很难与其他原子结合形成分子</strong>。 　　在地球上，还没有发现天然形成的惰性气体化合物。从上个世纪开始，科学家就在实验室中尝试将惰性气体的原子合成分子。1925 年，科学家在实验室中设法让氦（He）与氢离子（H?）共享一个电子，合成了第一个<strong>氦合氢离子</strong>（HeH?）。天文学家将氦合氢离子称为“分子”，但由于它并不是电中性的，化学家更愿意称之为“分子离子”。 　　1962 年，化学家<strong>尼尔·巴特利特</strong>（Neil Bartlett）诱导氙（Xe）、氟和铂结合，得到了一个芥黄色的化合物——<strong>六氟合铂酸氙</strong>，这是一个电中性分子，也是第一个电中性的惰性气体化合物分子。 　　但在宇宙中，情况可能大不一样。太空是一个寻找惰性气体化合物分子的绝佳场所。惰性气体元素在宇宙中十分丰富。氦是仅次于氢的宇宙中第二丰富的元素，氖（Ne）的丰度大约排在第五或第六名。在星际空间中，温度和密度时常达到极端情况

DOCK6学习II DOCK6 的工作流程 DOCK6工作流程概论 DOCK6基本理念 DOCK6相关概念 (A)Sphere Centers (B)化学匹配 (C) Critical Points (D)Bump Filter DOCK6 的工作流程 本文是咸鱼博主根据dock6.9的手册总结出，只是针对小分子-蛋白相互作用和Amber Score。感觉也不会有人看，但又怕后面没人接暂时写下来的了233。（实际上就是个搬运翻译而已和自己的操作而已啦。） DOCK6工作流程概论 DOCK6.9的工作流程如图。首先是根据`受体（Receptor）和配体（ligand）的几何坐标来进行准备，而后进行docking。受体的准备有三个流程： Sphgen ， Grid 和 DOCK 。 Sphgen 流程识别相应位点，并生成可填满位点的球心。 Grid 流程则生成记分网格。在程序 DOCK 中， DOCK 将球体（由 Sphgen 生成）与配体原子相匹配，并使用记分网格（来自 Grid ）来评估配体的取向。程序对接还可以最小化基于能量的分数。 DOCK6基本理念 针对docking,DOCK的处理方式是： （１）确定配体相对蛋白的方位, （２）确定给配体方位的打分方式. DOCK这个方式中的两种处理方式都可以进行替换。替换成自己需要的方式来进行 确定配体的方位的步骤： (１

ylbtech-化学-分子间作用力：百科 分子间作用力，又称范德瓦尔斯力（van der Waals force）。是存在于中性分子或原子之间的一种 弱碱性 的电性吸引力。分子间作用力（范德瓦尔斯力）有三个来源：① 极性分子 的永久 偶极矩 之间的相互作用。②一个极性分子使另一个分子极化，产生诱导偶极矩并相互吸引。③分子中电子的运动产生瞬时偶极矩，它使临近分子瞬时 极化 ，后者又反过来增强原来分子的瞬时偶极矩；这种相互耦合产生静电吸引作用，这三种力的贡献不同，通常第三种作用的贡献最大。 分子间作用力只存在于 分子 (molecule)与分子之间或 惰性气体 (noble gas) 原子 (atom)间的作用力，又称范德华力(van der waals)，具有 加和性 ，属于 次级键 。 氢键 (hydrogen bond)、弱 范德华力 、 疏水 作用力、芳环堆积作用、 卤键 都属于 次级键 （又称分子间弱相互作用）。 1. 返回顶部 1、 中文名：分子间作用力 外文名：intermolecular force 别 名：范德华力，范氏力 作用对象：分子之间 高分子化合物内官能团 一般分类： 范德华力 、 氢键 、其他非共价键 来源分类： 色散力 ， 取向力 ， 诱导力 ，其他 归 属：化学，力，分子间力 目录 1 氢键 2 作用力分类 ▪ 色散力 ▪ 诱导力 ▪ 取向力 ▪

本文转载自： http://blog.sina.com.cn/zhangsummer183 计算A、B分子间的弱相互作用能时，一般不能简单地通过E_interaction = E_AB - E(A) - E(B)来计算，因为E_AB能量相对于E(A) + E(B)的降低来自两方面，一方面是真实的A、B分子间的相互作用能，这是我们要求的；另一方面来自于A、B分子的基函数在复合物体系中重叠，相当于增大了复合物的基组而使E(AB)能量降低（严格来说前提是所用的理论方法是基于变分原理的），这个部分贡献如果也掺入E_interaction，则高估了相互作用能（即实际上结合能没有算出来的那么负），所以要去掉，它称为Basis Set Superposition Error(BSSE)。所以双分子的相互作用能应该表述为E_interaction = E_AB - E(A) - E(B) + E_BSSE。对于弱相互作用，E_BSSE所占E_interaction的比例往往不小，甚至超过它，如果不进行校正，可能正负号都不对。 基组越小，单体间相互作用越弱则E_BSSE越大。E_BSSE会随基组趋于完备而逐渐减小至0，给基组加上弥散函数能有效减小E_BSSE。对于氢键复合物，由于相互作用不算很弱，所以用了带弥散的中上等基组后，不做BSSE校正无妨。而pi-pi相互作用，即便用了aug-cc

部分元素核电荷数、名称及其符号 1 氢H 2氦He 3锂Li 4铍Be 5硼B 6 碳C 7氮N 8氧O 9氟F 10氖Ne 11 钠Na 12镁Mg 13铝Al 14硅Si 15磷P 16 硫S 17氯Cl 18氩Ar 19钾K 20钙Ca 21 钪(kàng) Sc 22钛Ti 23钒( f án) V 24铬( g è) Cr 25锰Mn 26 铁Fe 27钴( g ǔ) Co 28镍( ni è) Ni 29铜Cu 30锌Zn 31 镓( ji ā) Ga 32锗( zh ě) Ge 33砷( sh ēn) As 34硒Se 35溴Br 36 氪Kr 47 银Ag 50锡Sn 53碘I 56钡Ba 74钨W 79 金Au 80汞Hg 82铅Pb 第一主族：锂钠钾铷(Rb)铯(Cs)钫(Fr). 稀有气体：氦氖氩氪氙(Xe)氡(Rn). 部分元素常见化合价 钾 钠 银 氢 +1 价 氟 氯 溴 碘 -1 价 钙 镁 钡 锌 +2 价 1 2 铜 2 3 铁 2 4 碳 -2 氧 3 铝 4 硅 5 磷 4 7 锰 -2 4 6 硫 -3 5 氮 原子团 氢氧 根离子 OH - -1 硫 酸根离子 SO 4 2- -2 硝 酸根离子 NO 3 - -1 碳 酸根离子 CO 3 2- -2 碳 酸氢根离子 HCO 3 - -1 铵根离子 NH 4 + +1 氯酸根离子 ClO 3