第二代dna测序技术

三代基因组测序技术原理简介

只谈情不闲聊 提交于 2020-01-16 23:37:21
考虑到cnblog不适合基因组领域这种类型的文章, 最终,我自己开通了公众号:碱基矿工,欢迎感兴趣的同学关注! 也可以关注我的知乎:https://www.zhihu.com/people/yellowtree/activities 2018年1月修改:这篇文章写于2013年,首发在cnblog上,目前已经比较旧了。我重新在WGS系列中对其进行重写, 建议移步到这里   摘要: 从1977年第一代DNA测序技术(Sanger法) 1 ,发展至今三十多年时间,测序技术已取得了相当大的发展,从第一代到第三代乃至第四代,测序读长从长到短,再从短到长。虽然就当前形势看来第二代短读长测序技术在全球测序市场上仍然占有着绝对的优势位置,但第三和第四代测序技术也已在这一两年的时间中快速发展着。测序技术的每一次变革,也都对基因组研究,疾病医疗研究,药物研发,育种等领域产生巨大的推动作用。在这里我主要对当前的测序技术以及它们的测序原理做一个简单的小结。 图1:测序技术的发展历程   生命体遗传信息的快速获得对于生命科学的研究有着十分重要的意义。以上(图1)所描述的是自沃森和克里克在1953年建立DNA双螺旋结构以来,整个测序技术的发展历程。 第一代测序技术   第一代DNA测序技术用的是1975年由桑格(Sanger)和考尔森(Coulson)开创的链终止法或者是1976-1977年由马克西姆

买个什么样的测序仪?

空扰寡人 提交于 2019-11-30 19:39:33
买个什么样的测序仪? 已有 2610 次阅读 2019-7-16 14:26 | 个人分类: 生物科技 | 系统分类: 观点评述 | DNA , 测序仪 , 分子检测 近些年来,人类全基因组测序或全外显子组测序在临床上的应用越来越多,基因测序的价格越来越低,基因测序仪的也越来越便宜。许多大的医院也在开始考虑购买测序仪,建立自己的基因测序系统,用于各种相关疾病的基因检测和分子诊断。 有自己的测序仪当然是好事。但是,考虑到仪器价格昂贵,不容易操作,数据分析专业性极强等因素,因此,在花费数百万和数千万资金之前,还是要慎重考虑一下。因为,请专业测序公司来做的费用越来越低。 本文对市售的不同DNA测序仪的特性,有什么优点?缺点是什么?在什么情况和条件下,应该购买什么样的测序仪?做一简短回顾。 illumina HiSeq X Ten HiSeq X Ten实际上是十台HiSeq X组成。每个HiSeq X仪器可以运行两个流动槽,每个流动槽有8个泳道。每个泳道将产生380-450百万个150PE读数(paired-end 150bp)。预计将在计算系统上额外支付数百万元来处理数据流。保持流动槽有序运行不太容易,有时可能导致高达30%的“光学信号重叠,optical duplicates”(实际原因是从一个孔溢出到相邻的孔)。你可以达到每3天测定160个基因组。目前