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文献速递20200524

旧街凉风 提交于 2020-07-27 10:57:19
一 文献题目: Characterizing the Causal Pathway for Genetic Variants Associated with Neurological Phenotypes Using Human Brain-Derived Proteome Data 不想看英文题目: 使用人脑蛋白质组学数据鉴定神经表型相关的遗传位点 杂志和影响因子: Am J Hum Genet (IF: 9.924) 分析方法: 使用共定位的方法鉴定pQTL位点与疾病相关位点是否在同一遗传座上(coloc方法:PPA > 0.8; eCAVIAR方法:CLPP > 0.01) 结论: 利用GWAS+蛋白质组学的方法鉴定了12个基因座的位点同时影响疾病和蛋白质。基因多效性研究发现SNX32同时影响多种表型,例如身高、腰臀比、阿尔兹海默症等,且影响的方向是不一致的,而SARM1基因则没有表现基因多效性,只影响神经表型,说明该基因可作为研究治疗的潜在靶基因。 文章链接: https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/32413284/ 二 文献题目: Summary-Based Methylome-Wide Association Analyses Suggest Potential Genetically Driven Epigenetic

文献速递20200524

只愿长相守 提交于 2020-07-27 10:56:50
一 文献题目: Characterizing the Causal Pathway for Genetic Variants Associated with Neurological Phenotypes Using Human Brain-Derived Proteome Data 不想看英文题目: 使用人脑蛋白质组学数据鉴定神经表型相关的遗传位点 杂志和影响因子: Am J Hum Genet (IF: 9.924) 分析方法: 使用共定位的方法鉴定pQTL位点与疾病相关位点是否在同一遗传座上(coloc方法:PPA > 0.8; eCAVIAR方法:CLPP > 0.01) 结论: 利用GWAS+蛋白质组学的方法鉴定了12个基因座的位点同时影响疾病和蛋白质。基因多效性研究发现SNX32同时影响多种表型,例如身高、腰臀比、阿尔兹海默症等,且影响的方向是不一致的,而SARM1基因则没有表现基因多效性,只影响神经表型,说明该基因可作为研究治疗的潜在靶基因。 文章链接: https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/32413284/ 二 文献题目: Summary-Based Methylome-Wide Association Analyses Suggest Potential Genetically Driven Epigenetic

hint不当索引,影响多表连接方式,最终导致SQL执行缓慢

╄→гoц情女王★ 提交于 2020-04-18 05:51:20
需求:一个SQL执行特别慢,无法返回结果,需要进行优化,最终返回结果即可。 一、SQL分析 二、尝试执行,观测执行计划 三、修改SQL 四、问题总结 一、SQL分析 1 )SQL文本,执行时间,执行用户 用户brjljk sql执行时间,2935分钟 sql_text select c.hphm, c.ccdjrq, c.clpp1, c.clxh, c.zt, c.syr, c.wfsj, c.wfxw, c.dsr, c.xxly, c.syq, c.wfsj1, d.wfnr, e.dlmc, c.xxly1, c.dsr1 from ( select /* + index(b idx_violation_wfsj) */ a.hphm, a.ccdjrq, a.clpp1, a.clxh, a.zt, a.syr, a.wfsj, a.wfxw, a.dsr, a.xxly, a.syq, b.wfsj wfsj1, b.wfxw wfxw1, b.wfdd wfdd1, b.xxly xxly1, b.dsr dsr1 from A a right join B b on a.hphm = b.hphm where a.wfsj <> b.wfsj and (b.wfsj < add_months(a.wfsj, 12 ) and b.wfsj > add_months