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新冠病毒药物研发分秒必争,阿里高性能计算如何出力?

早过忘川 提交于 2020-03-25 07:20:21
3 月,跳不动了?>>> 阿里妹导读: 新冠状病毒疫情发生后,为了帮助抗攻击疫情,阿里云免费向全球公共科研机构提供高性能计算、SCC超级计算集群和>CPU/GPU机器、云超算及AI等技术。 近期,不少研究机构和高校在阿里云上E-HPC云超算上进行药物研发相关的数值计算,阿里云超算团队提供了技术支持与跟进。 本文主要介绍药物筛选阶段,E-HPC云超算如何帮助研发人员实现大量小分子库的快速并发处理。同时,介绍全球健康药物研发中心GHDDI算>力和成果共享开放平台的阿里云解决方案。 病毒、药物研发和高性能计算 一款药物的诞生周期极其漫长,从最早的新药研发到上市,至少要经历10年。 在疫情这般分秒必争的背景下,时间尤为珍贵。因此在本次过程中,许多科学家会尝试从已有的药物里面,找到能治疗新冠的药,免去了后续大量审批上市等步骤。 化合物发现阶段,以往的方法是通过大量实验做筛选,发现可能适合的化合物。如今,科学家尝试通过机器模拟分子化合物与靶点的相互作用,从而筛选出可能有效的化合物做实验。 在此过程中,高性能计算(HighPerformance Computing,简称HPC),常被称为“超算”,是现代药物研发必不可少的支持。 云计算的兴起更是改变了科学家获取算力、享受超算服务的方式。比如阿里云E-HPC 云超算产品,能够让科学家自助在云上搭建高性能集群系统,满足药物研发人员对计算平台的需求。