Step detection in one-dimensional data

前端 未结 1 1390
暗喜
暗喜 2021-02-01 05:29

Is there an existing implementation in Python for detecting steps in one dimensional data?

E.g. something that detects one step in this data:

There are

相关标签:
1条回答
  • 2021-02-01 06:23

    convolve with a step, see if peak resolution is good enough

    import numpy as np
    from matplotlib import pyplot as plt
    
    
    d = '''594.          568.55555556  577.22222222  624.55555556  546.66666667
    552.88888889  575.55555556  592.33333333  528.88888889  576.11111111
    625.          574.22222222  556.33333333  567.66666667  576.66666667
    591.66666667  566.33333333  567.33333333  547.44444444  631.11111111
    555.66666667  548.66666667  579.44444444  546.88888889  597.55555556
    519.88888889  582.33333333  618.88888889  574.55555556  547.44444444
    593.11111111  565.66666667  544.66666667  562.66666667  554.11111111
    543.88888889  602.33333333  609.77777778  550.55555556  561.88888889
    719.33333333  784.44444444  711.22222222  843.66666667  691.33333333
    690.11111111  684.33333333  749.11111111  759.11111111  653.33333333
    817.11111111  705.22222222  689.44444444  712.33333333  659.
    683.88888889  713.          740.44444444  692.22222222  677.33333333
    681.44444444  640.          717.55555556  717.88888889  769.22222222
    690.88888889  786.          774.66666667  799.44444444  743.44444444
    789.88888889  673.66666667  685.66666667  709.88888889  645.55555556
    846.11111111  792.77777778  702.22222222  749.44444444  678.55555556
    707.55555556  665.77777778  643.55555556  671.44444444  795.66666667
    627.22222222  684.55555556  708.44444444  829.66666667  719.        '''
    
    dary = np.array([*map(float, d.split())])
    
    dary -= np.average(dary)
    
    step = np.hstack((np.ones(len(dary)), -1*np.ones(len(dary))))
    
    dary_step = np.convolve(dary, step, mode='valid')
    
    # get the peak of the convolution, its index
    
    step_indx = np.argmax(dary_step)  # yes, cleaner than np.where(dary_step == dary_step.max())[0][0]
    
    # plots
    
    plt.plot(dary)
    
    plt.plot(dary_step/10)
    
    plt.plot((step_indx, step_indx), (dary_step[step_indx]/10, 0), 'r')
    

    0 讨论(0)
提交回复
热议问题